24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5778 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5778  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
316 aa  635    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3515  aminoglycoside phosphotransferase  52.52 
 
 
316 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5785  hypothetical protein  47.21 
 
 
306 aa  271  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4715  hypothetical protein  53.44 
 
 
309 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.27974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4801  hypothetical protein  53.44 
 
 
309 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5100  hypothetical protein  53.77 
 
 
309 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1045  hypothetical protein  45.13 
 
 
318 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0988  aminoglycoside phosphotransferase  36.36 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 
296 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  29.85 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0869  aminoglycoside phosphotransferase  31.39 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  29.17 
 
 
285 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  30.13 
 
 
288 aa  62.8  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  29.91 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3466  aminoglycoside phosphotransferase  27.95 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2690  aminoglycoside phosphotransferase  29.24 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00019331  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  27.08 
 
 
295 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  26.5 
 
 
302 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  24.74 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4410  aminoglycoside phosphotransferase  29.17 
 
 
314 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362024  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  28.65 
 
 
256 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1225  aminoglycoside phosphotransferase  27.27 
 
 
302 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.84764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  25.53 
 
 
303 aa  45.8  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  28.05 
 
 
298 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>