264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5734 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
199 aa  397  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  42.49 
 
 
177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  40 
 
 
203 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 
197 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7124  transcriptional regulator  32.64 
 
 
203 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5790  hypothetical protein  33.67 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 
199 aa  95.5  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
199 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
215 aa  92.8  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 
206 aa  91.7  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
196 aa  89.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
197 aa  89.4  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0254  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.631026 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 
196 aa  84.3  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5475  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 
202 aa  82  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4367  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3495  putative transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 
367 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8695  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.650286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  30 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0541  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.451413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2809  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00640157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  29.38 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1664  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  30.05 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2212  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326547  normal  0.584634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5183  putative transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0142854 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2069  regulatory protein, TetR  35.87 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.168032  normal  0.867534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
226 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 
197 aa  61.2  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4308  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 
195 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0100295  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  35.04 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 
204 aa  58.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  33.62 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  27.59 
 
 
287 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2687  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782088  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  27.4 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19310  hypothetical protein  28.48 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 
206 aa  55.1  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
236 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  32.62 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 
211 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 
199 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  30.37 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
203 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 
240 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
245 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4321  regulatory protein TetR  26.73 
 
 
194 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0684654  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  23.08 
 
 
207 aa  52  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
203 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 
212 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
203 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
200 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  42.86 
 
 
188 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 
210 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  30.41 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  28.87 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  29.63 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  29.63 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  29.58 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  29.58 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  29.58 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  29.63 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  28.12 
 
 
218 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  27.13 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  27.13 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 
207 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  25.38 
 
 
198 aa  49.3  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 
225 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>