More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5704 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5704  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 458 aa  909    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.715855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0316  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.94 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0273  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.73 
 
 		 464 aa  519  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  55.48 
 
 		 455 aa  451  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  54.99 
 
 		 455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  51.21 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  51.09 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3056  FAD linked oxidase domain protein  52.57 
 
 		 482 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2230  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.8 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  49.34 
 
 		 479 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3961  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.89 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.89 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153769  normal  0.0426559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4035  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.89 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4261  FAD linked oxidase domain protein  49.12 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371962  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22220  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  48.8 
 
 		 496 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.10573  normal  0.191937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4464  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.67 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2008  FAD linked oxidase domain protein  51.77 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5223  FAD linked oxidase domain protein  48.05 
 
 		 462 aa  382  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11283  oxidoreductase  47.88 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6354  putative glycolate oxidase  49.01 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0353513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1052  FAD linked oxidase domain protein  47.01 
 
 		 470 aa  359  6e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2143  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.34 
 
 		 442 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.165769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3277  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.45 
 
 		 453 aa  355  7.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.450934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  42.29 
 
 		 472 aa  341  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0748  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.71 
 
 		 456 aa  339  5e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  43.57 
 
 		 466 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.2 
 
 		 469 aa  335  7e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0766  FAD linked oxidase domain protein  46.91 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0491548  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1623  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  40.97 
 
 		 457 aa  330  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  44.15 
 
 		 466 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2483  FAD linked oxidase domain protein  46.77 
 
 		 459 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4307  FAD linked oxidase domain protein  47.79 
 
 		 447 aa  328  9e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.99 
 
 		 460 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0865  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.61 
 
 		 456 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  40.09 
 
 		 462 aa  327  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  39.87 
 
 		 457 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  39.65 
 
 		 461 aa  326  6e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.3 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.3 
 
 		 460 aa  325  1e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.3 
 
 		 460 aa  325  2e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0177  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.95 
 
 		 449 aa  323  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2199  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.19 
 
 		 457 aa  322  8e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000163429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2540  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.34 
 
 		 464 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00114883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.75 
 
 		 470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.85 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  39.74 
 
 		 466 aa  320  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.14 
 
 		 451 aa  319  5e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  41.72 
 
 		 459 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1038  FAD linked oxidase domain protein  41.34 
 
 		 461 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00807921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  46.32 
 
 		 457 aa  316  6e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  38.9 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  41.5 
 
 		 459 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.95 
 
 		 459 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  37.67 
 
 		 462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.11 
 
 		 459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  40.19 
 
 		 470 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.19 
 
 		 470 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  40.19 
 
 		 470 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  39.95 
 
 		 470 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.95 
 
 		 470 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  44.47 
 
 		 506 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  39.71 
 
 		 470 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.58 
 
 		 470 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  39.71 
 
 		 470 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.95 
 
 		 470 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  39.51 
 
 		 459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2414  FAD linked oxidase-like  47.25 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.344385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  38.86 
 
 		 461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  42.45 
 
 		 462 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  39.34 
 
 		 459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  42.89 
 
 		 462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2000  FAD linked oxidase domain protein  42.23 
 
 		 462 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  39.71 
 
 		 470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3239  glycolate oxidase, subunit GlcD  41.19 
 
 		 460 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2139  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.24 
 
 		 475 aa  306  4.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.24 
 
 		 481 aa  306  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0525  FAD linked oxidase domain protein  37.97 
 
 		 456 aa  306  6e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00145948  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  42.69 
 
 		 498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  42.93 
 
 		 499 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  41.15 
 
 		 484 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0392  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.82 
 
 		 460 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.769694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0346  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.27 
 
 		 461 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.307472  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.56 
 
 		 493 aa  302  9e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1218  glycolate oxidase  38.6 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0359415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0708  FAD linked oxidase domain protein  38.63 
 
 		 460 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  43.17 
 
 		 499 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 		 464 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.69 
 
 		 499 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.41 
 
 		 488 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  40.22 
 
 		 499 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  42.93 
 
 		 499 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1046  FAD linked oxidase domain protein  40.14 
 
 		 462 aa  297  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.284035  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0002  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.06 
 
 		 462 aa  297  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.48 
 
 		 473 aa  298  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.41 
 
 		 488 aa  296  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.11 
 
 		 459 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3331  glycolate oxidase subunit GlcD  42.45 
 
 		 499 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000167182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  42.21 
 
 		 499 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  41.97 
 
 		 499 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  39.34 
 
 		 499 aa  292  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>