More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5689 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 314 aa  626  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  51.36 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  44.11 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  40.83 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  36.81 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  38.54 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 298 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  38.96 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 300 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  35.47 
 
 		 287 aa  139  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  36.65 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  33.97 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  39.68 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 311 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  31.46 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  36.51 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  35.94 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  32.33 
 
 		 308 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  35.18 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  33.73 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  33.6 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  35.83 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 375 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  35.55 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  34.7 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  31.51 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  32.85 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  30.63 
 
 		 300 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  31.99 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 323 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 323 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 323 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  32.29 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.98 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0898  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  32.55 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 338 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 283 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  37.14 
 
 		 308 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  30.24 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  33.07 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 		 296 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  33.81 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3794  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689518 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  32.57 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  33.2 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.1 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  35.22 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  30.43 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19670  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.663565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1693  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  31.76 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.69 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>