More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5681 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  100 
 
 
242 aa  487  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  59.09 
 
 
243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  59.67 
 
 
243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  58.68 
 
 
243 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  55.56 
 
 
244 aa  258  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  56.61 
 
 
243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  57.08 
 
 
243 aa  255  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  54.96 
 
 
243 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  34.15 
 
 
270 aa  112  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  33.2 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  28.45 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  32.52 
 
 
251 aa  89  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  32.39 
 
 
255 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  31.98 
 
 
255 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  31.98 
 
 
255 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  31.98 
 
 
260 aa  85.1  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  31.98 
 
 
255 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  31.98 
 
 
255 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  31.98 
 
 
255 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  31.98 
 
 
255 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  31.98 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  31.17 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  31.98 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  31.98 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  31.17 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  31.84 
 
 
255 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  30.77 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  28.4 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  31.15 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  29.84 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  28.27 
 
 
250 aa  78.6  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  31.25 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  29.58 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.81 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  29.39 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  28.46 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.71 
 
 
224 aa  72  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  26.5 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  26.42 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  28.16 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  35.45 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  35.45 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  25.87 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.49 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  32.03 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  27.42 
 
 
263 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  27.13 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  33.61 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  23.4 
 
 
232 aa  62  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  28.79 
 
 
254 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  22.09 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  32.14 
 
 
334 aa  59.3  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  31.82 
 
 
230 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  31.53 
 
 
399 aa  59.3  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  27.53 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  23.74 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.88 
 
 
374 aa  58.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  24.89 
 
 
616 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  27.34 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
257 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  21.2 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  31.53 
 
 
348 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  35.04 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  29.73 
 
 
776 aa  56.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.33 
 
 
400 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  30.36 
 
 
222 aa  56.2  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  34.17 
 
 
245 aa  55.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  41.56 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  28.21 
 
 
385 aa  55.8  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  30.19 
 
 
232 aa  55.5  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  40.26 
 
 
240 aa  55.1  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  28.44 
 
 
391 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  31.82 
 
 
392 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  26.34 
 
 
388 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  46.03 
 
 
238 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.35 
 
 
400 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  36.04 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  39.29 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  33.94 
 
 
397 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  27.5 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  20.77 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  31.53 
 
 
400 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  27.27 
 
 
384 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  21.32 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  40.48 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.36 
 
 
358 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  28.19 
 
 
241 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  34.38 
 
 
522 aa  52.8  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.38 
 
 
241 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  25.83 
 
 
816 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  26.42 
 
 
400 aa  53.1  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  22.48 
 
 
630 aa  52.8  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.36 
 
 
355 aa  52.4  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.48 
 
 
355 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.79 
 
 
355 aa  52.4  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4933  histidinol-phosphate phosphatase family protein  34.58 
 
 
401 aa  52  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295691  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  24.23 
 
 
403 aa  52  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  31.36 
 
 
247 aa  52  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  35.9 
 
 
397 aa  52  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  42.5 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.555479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>