More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5654 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 449 aa  934    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4676  Radical SAM domain-containing protein  52.98 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.100099  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3241  radical SAM family protein  35.97 
 
 		 329 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.036472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 339 aa  180  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1058  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 455 aa  153  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 		 447 aa  149  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2384  Radical SAM domain protein  28.53 
 
 		 339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.597572  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  29.8 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 450 aa  140  6e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1961  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 440 aa  123  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1246  radical SAM family protein  26.96 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0936067  normal  0.0177716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0478  radical SAM family protein  27.37 
 
 		 448 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1456  radical SAM domain-containing protein  27.9 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1501  radical SAM domain-containing protein  27.9 
 
 		 454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0897  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 		 454 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  27.9 
 
 		 400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0042  radical SAM family protein  26.7 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0668  radical SAM domain-containing protein  22.49 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1962  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  26.11 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  27.4 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 443 aa  97.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0076  Radical SAM domain protein  24 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  24.52 
 
 		 483 aa  90.9  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0575  Radical SAM domain protein  28.15 
 
 		 434 aa  90.1  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1828  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00146977 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 446 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 		 510 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1357  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07060  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  27.17 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6334  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0725918  hitchhiker  0.00194618 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 		 468 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  28.98 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0783  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2359  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.288415  hitchhiker  0.00183234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2899  Radical SAM domain protein  28.05 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3221  radical SAM domain-containing protein  22.81 
 
 		 484 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.726288  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  33.12 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 		 453 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1480  radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.227708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  28.76 
 
 		 450 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 481 aa  67  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 457 aa  67  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2677  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.773927  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  25.26 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 		 728 aa  66.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  21.39 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.86 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  31.61 
 
 		 518 aa  64.7  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.27 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  26.09 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.75 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0176  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.68 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  26.29 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  30.87 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  26.29 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0197  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.92 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  27.91 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4347  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  29.32 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0157  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.68 
 
 		 320 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  25.66 
 
 		 470 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  26.42 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  30.38 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  25.68 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  28.12 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  22.63 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  23.04 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  23.04 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  28.22 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>