More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5651 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 219 aa  417  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  62.62 
 
 		 235 aa  236  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 242 aa  114  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  34.11 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 244 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 265 aa  101  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1711  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.968918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  39.71 
 
 		 229 aa  98.2  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 243 aa  95.5  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.000000224678  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 290 aa  94.7  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 247 aa  94  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  37.85 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4045  transcriptional regulator, GntR family  39.11 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 257 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 262 aa  89  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 229 aa  88.6  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 223 aa  88.6  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  88.2  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 267 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 247 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4601  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100145 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 238 aa  85.9  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 258 aa  85.9  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 233 aa  85.5  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0606  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 227 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 258 aa  85.1  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 		 234 aa  85.1  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4133  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  42 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3148  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.275687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  33.63 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>