More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5625 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
240 aa  467  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 
223 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
227 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  38.92 
 
 
223 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 
245 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  38.57 
 
 
222 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 
233 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
217 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
231 aa  99  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  38.15 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 
244 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 
231 aa  96.3  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
202 aa  95.9  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 
221 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
229 aa  92.4  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
219 aa  92  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  34.48 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  42.18 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0628  transcriptional regulator protein  35.68 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
267 aa  89.4  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
226 aa  89  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
247 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 
224 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
229 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 
223 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
223 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 
238 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
232 aa  86.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 
219 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 
251 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  37.72 
 
 
232 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
230 aa  85.9  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
225 aa  85.9  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
224 aa  85.5  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
234 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
218 aa  85.5  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 
226 aa  85.1  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 
263 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2935  transcriptional regulator, GntR family  36.6 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000424024  hitchhiker  0.000467948 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6551  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 
230 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0158828  normal  0.969199 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  36.65 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  36.25 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  39.01 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  37.21 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  32.85 
 
 
231 aa  82.4  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  36.6 
 
 
222 aa  82  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0931  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
242 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 
229 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2218  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5580  transcriptional regulator, GntR family  37.86 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 
229 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  34.05 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>