More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5620 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5620  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 488 aa  940    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000613899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4580  major facilitator superfamily MFS_1  51.78 
 
 		 500 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1276  major facilitator superfamily MFS_1  52.16 
 
 		 483 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8690  major facilitator superfamily MFS_1  50.21 
 
 		 507 aa  348  9e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1718  major facilitator superfamily MFS_1  48.79 
 
 		 500 aa  345  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0892  major facilitator superfamily MFS_1  47.38 
 
 		 508 aa  342  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  43.88 
 
 		 472 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  41.83 
 
 		 478 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  41.92 
 
 		 489 aa  292  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3744  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 		 484 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.44 
 
 		 487 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.41 
 
 		 487 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.03 
 
 		 763 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1035  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 466 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.98 
 
 		 527 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0772  major facilitator superfamily transporter  35.94 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.67 
 
 		 474 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0901  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 		 466 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.38 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  34.9 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.08 
 
 		 493 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  36.36 
 
 		 492 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  34.2 
 
 		 475 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4526  efflux transporter  50.41 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344651  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.8 
 
 		 507 aa  196  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.06 
 
 		 519 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  32.69 
 
 		 497 aa  195  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.43 
 
 		 490 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 485 aa  193  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.41 
 
 		 509 aa  193  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.51 
 
 		 522 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.04 
 
 		 487 aa  189  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 490 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 		 494 aa  186  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 		 482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 		 482 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 		 757 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  32.92 
 
 		 481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.27 
 
 		 553 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 487 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  32.05 
 
 		 470 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  36.25 
 
 		 482 aa  180  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.42 
 
 		 788 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 481 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.95 
 
 		 487 aa  176  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.03 
 
 		 514 aa  176  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.34 
 
 		 489 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.56 
 
 		 496 aa  176  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  32.59 
 
 		 458 aa  176  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 503 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.62 
 
 		 505 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4316  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 486 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.48 
 
 		 508 aa  174  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.09 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 		 1112 aa  172  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.8 
 
 		 479 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 491 aa  170  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  33.56 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 		 513 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.64 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5138  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  31.71 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.82 
 
 		 499 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.57 
 
 		 482 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.86 
 
 		 506 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.46 
 
 		 501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  33.77 
 
 		 454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4141  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 486 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 733 aa  162  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.49 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  37.91 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.19 
 
 		 534 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.54 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0548  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 471 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.06 
 
 		 502 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.95 
 
 		 502 aa  160  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.52 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 470 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0272  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  33.82 
 
 		 494 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 		 479 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 		 479 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.89 
 
 		 479 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0337  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 		 494 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0498428  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  34.03 
 
 		 489 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 457 aa  159  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.65 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.84 
 
 		 519 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.92 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 478 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 		 500 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1149  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 460 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3892  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 		 511 aa  157  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.741716  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 468 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>