261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5560 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  100 
 
 
437 aa  897    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  55.06 
 
 
313 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3786  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  55.76 
 
 
1131 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550121  normal  0.857915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1707  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  51.29 
 
 
1147 aa  293  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.255269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  53.02 
 
 
1077 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2070  peptidase M28  47.76 
 
 
309 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0792  Aminopeptidase S  50.52 
 
 
502 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4953  Aminopeptidase Y  49.83 
 
 
312 aa  262  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000539028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0075  peptidase M28  39.51 
 
 
947 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.11414  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1367  aminopeptidase Y  47.12 
 
 
519 aa  256  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.227193  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1408  aminopeptidase Y  45.57 
 
 
518 aa  247  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1604  peptidase M28  43.62 
 
 
291 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.548091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01630  aminopeptidase Y  44.16 
 
 
509 aa  170  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.777606  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2223  putative aminopeptidase  43.78 
 
 
535 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0754  Aminopeptidase S  43.1 
 
 
512 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3246  aminopeptidase Y  41.54 
 
 
518 aa  160  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.765312  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26020  putative aminopeptidase  43.32 
 
 
536 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.394851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  42.92 
 
 
512 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  42.01 
 
 
555 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3913  Aminopeptidase Y  42.34 
 
 
512 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0141  Aminopeptidase Y  43.24 
 
 
506 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0190  aminopeptidase Y  41.3 
 
 
510 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0189  aminopeptidase Y  41.08 
 
 
488 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0554  aminopeptidase Y  42.48 
 
 
479 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0566  aminopeptidase Y  42.48 
 
 
479 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0537512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0544  aminopeptidase Y  42.48 
 
 
479 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.282981  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8952  Aminopeptidase Y  41.2 
 
 
515 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0927  Aminopeptidase Y  41.56 
 
 
548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464767  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0553  aminopeptidase Y  37.14 
 
 
501 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0565  aminopeptidase Y  37.14 
 
 
501 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10423  lipoprotein aminopeptidase lpqL  38.17 
 
 
500 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0596975  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0543  aminopeptidase Y  37.14 
 
 
501 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207964  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0344  Aminopeptidase Y  38.65 
 
 
534 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138174  normal  0.69761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  38.98 
 
 
512 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1182  Aminopeptidase Y  38.08 
 
 
481 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0716  aminopeptidase Y  38.77 
 
 
488 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.841416  normal  0.0176108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3147  Aminopeptidase Y  39.83 
 
 
513 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.248558  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0039  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  61.4 
 
 
519 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0715  aminopeptidase Y  38.46 
 
 
502 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0168155 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2343  Aminopeptidase Y  39.73 
 
 
512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.362822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0793  Aminopeptidase Y  38.75 
 
 
514 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0141  peptidase M28  42.86 
 
 
524 aa  133  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.481582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0044  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  60.91 
 
 
518 aa  130  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61029 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03918  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00220)  36.82 
 
 
502 aa  124  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0943032 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89245  Aminopeptidase yscIII Transferrin receptor  38.34 
 
 
533 aa  120  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08445  aminopeptidase Y, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00650)  35.59 
 
 
503 aa  116  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6580  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.22 
 
 
519 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2361  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.52 
 
 
563 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0874111  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30600  subtilisin-like serine protease  42.73 
 
 
524 aa  87.8  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  41.18 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  35.26 
 
 
775 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2202  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.48 
 
 
597 aa  79.7  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176046  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35 
 
 
823 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  37.27 
 
 
803 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5215  peptidase M28  31.46 
 
 
450 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.05114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  30.2 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  31.77 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1976  peptidase M28  30.93 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.242432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.78 
 
 
818 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.64 
 
 
807 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.84 
 
 
803 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.45 
 
 
802 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
809 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  34.94 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.84 
 
 
807 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.17 
 
 
819 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  28.77 
 
 
647 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.17 
 
 
819 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.17 
 
 
819 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.17 
 
 
819 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  32.46 
 
 
807 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1559  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  39.81 
 
 
514 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  28.77 
 
 
647 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0043  hypothetical protein  34.11 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.46 
 
 
805 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.46 
 
 
805 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  36.94 
 
 
794 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3997  peptidase M28  27.04 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.664765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  33.13 
 
 
1247 aa  67.4  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  26.77 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  26.63 
 
 
487 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1960  peptidases M20 and M28  31.11 
 
 
333 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0902014  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2406  peptidase M28  28.38 
 
 
584 aa  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00346495  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  43.59 
 
 
539 aa  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2729  hypothetical protein  28.97 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  27.5 
 
 
563 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  34.48 
 
 
373 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2866  hypothetical protein  28.97 
 
 
401 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  31.03 
 
 
598 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.23 
 
 
836 aa  61.6  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000775  regulatory P domain of the subtilisin-like proprotein convertase  33.94 
 
 
677 aa  61.6  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1537  peptidase M28  27.32 
 
 
571 aa  61.6  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191422 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.61 
 
 
835 aa  61.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  29.94 
 
 
944 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5330  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.22 
 
 
775 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.879852  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  33.33 
 
 
424 aa  60.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5056  aminopeptidase  29.65 
 
 
466 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.418047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5450  putative aminopeptidase  38.64 
 
 
466 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5606  aminopeptidase  38.64 
 
 
466 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5470  putative aminopeptidase  27.8 
 
 
466 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.155221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>