More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5558 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5558  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2836  alpha/beta hydrolase fold protein  39.74 
 
 		 236 aa  138  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.68472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 270 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 		 264 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.96 
 
 		 262 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.54 
 
 		 270 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 270 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 270 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 		 277 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 267 aa  85.5  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.09 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1540  putative hydrolase  32.48 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153847  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2192  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000941808  hitchhiker  0.00021747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  31.69 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  30.92 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1328  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  26.94 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.12 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  28.69 
 
 		 456 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.34 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  29.11 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.34 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.34 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  29.49 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  32.49 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  32.61 
 
 		 391 aa  75.1  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  27.66 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  28.57 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  27.57 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  32.79 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  29.71 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  33.61 
 
 		 397 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.58 
 
 		 370 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 275 aa  72  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  28.86 
 
 		 254 aa  72  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  30.49 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 271 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 340 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  30.81 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  28.05 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2045  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  27.31 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  31.47 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  28.91 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  31.01 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  32.78 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2105  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1380  alpha/beta hydrolase fold  23.65 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 		 290 aa  68.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  33.48 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  25.51 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.17 
 
 		 370 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 339 aa  68.6  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1735  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 346 aa  68.6  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  25.4 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003945  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase putative  26.78 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  26.83 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  26.45 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.36 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  27.35 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.31 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1067  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.03 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>