More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5481 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11390  ribonuclease, Rne/Rng family  71.43 
 
 		 1265 aa  692    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.320924  hitchhiker  0.00951871 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3624  ribonuclease  60 
 
 		 991 aa  638    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2058  ribonuclease, Rne/Rng family  59.07 
 
 		 1123 aa  637    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1618  ribonuclease, Rne/Rng family  69.87 
 
 		 944 aa  667    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127332  normal  0.810349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7273  ribonuclease, Rne/Rng family  68.67 
 
 		 1334 aa  684    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.584689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1186  ribonuclease, Rne/Rng family  68.83 
 
 		 974 aa  691    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2183  ribonuclease E and G  72.65 
 
 		 908 aa  672    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0295776  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12490  ribonuclease, Rne/Rng family  71.37 
 
 		 1093 aa  692    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3556  ribonuclease  60 
 
 		 987 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0805889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7272  Ribonuclease E  69.39 
 
 		 922 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.159287 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1472  ribonuclease, Rne/Rng family  63.64 
 
 		 1040 aa  669    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.800895  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1653  ribonuclease, Rne/Rng family  66.8 
 
 		 1018 aa  662    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000358703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5481  ribonuclease Rne/Rng family  100 
 
 		 717 aa  1433    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0824918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1218  ribonuclease  72.84 
 
 		 1194 aa  719    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.993223 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2284  ribonuclease, Rne/Rng family  66.34 
 
 		 1117 aa  692    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.436718  hitchhiker  0.00140455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5262  ribonuclease  69.41 
 
 		 1427 aa  716    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266118  normal  0.176556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3482  ribonuclease  73.99 
 
 		 1024 aa  754    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3861  ribonuclease  75.75 
 
 		 1058 aa  753    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1546  ribonuclease, Rne/Rng family  63.82 
 
 		 1041 aa  676    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.31372  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3551  ribonuclease  60 
 
 		 991 aa  638    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.788341  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2266  ribonuclease, Rne/Rng family  67.61 
 
 		 1043 aa  681    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.454961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2461  ribonuclease, Rne/Rng family  67.43 
 
 		 990 aa  660    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.384924  normal  0.18702 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18280  ribonuclease, Rne/Rng family  68.19 
 
 		 952 aa  679    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0683615  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3381  ribonuclease, Rne/Rng family  62.88 
 
 		 1007 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2393  ribonuclease  62.41 
 
 		 1113 aa  663    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1587  ribonuclease, Rne/Rng family  72.9 
 
 		 1048 aa  701    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0101858  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0755  ribonuclease G  69.32 
 
 		 702 aa  643    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2147  ribonuclease, Rne/Rng family  64.49 
 
 		 1151 aa  661    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000101232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3452  ribonuclease G  67.15 
 
 		 1070 aa  644    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1502  ribonuclease, Rne/Rng family  62.85 
 
 		 1080 aa  634  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.69502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10100  ribonuclease, Rne/Rng family  67.31 
 
 		 1091 aa  631  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2634  ribonuclease  64.64 
 
 		 1016 aa  625  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0104153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3947  ribonuclease  57.19 
 
 		 961 aa  621  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3458  ribonuclease, Rne/Rng family  69.89 
 
 		 1244 aa  619  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11530  RNAse G  66.3 
 
 		 959 aa  606  9.999999999999999e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0250639  normal  0.313443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12471  ribonuclease E rne  64.36 
 
 		 953 aa  599  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00011708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1615  ribonuclese G and E  59 
 
 		 1022 aa  549  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1224  S1 RNA binding domain protein  58.57 
 
 		 1093 aa  548  1e-154  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000769273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0770  ribonuclease, Rne/Rng family  50.36 
 
 		 457 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  43.03 
 
 		 559 aa  335  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  42.39 
 
 		 564 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2663  ribonuclease, Rne/Rng family  45.18 
 
 		 636 aa  326  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  42.54 
 
 		 494 aa  323  6e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  41.48 
 
 		 492 aa  322  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  42.42 
 
 		 483 aa  311  4e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1735  ribonuclease  41.33 
 
 		 499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.776298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  40.27 
 
 		 543 aa  308  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  38.69 
 
 		 503 aa  308  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000677215  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  40.82 
 
 		 491 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  39.71 
 
 		 496 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  39.71 
 
 		 496 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  41.01 
 
 		 562 aa  303  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  40.52 
 
 		 531 aa  303  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1593  ribonuclease  38.37 
 
 		 1128 aa  302  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247639 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02918  ribonuclease E  38.55 
 
 		 1035 aa  302  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  40.67 
 
 		 496 aa  302  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2129  ribonuclease, Rne/Rng family  42.79 
 
 		 571 aa  301  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0190807  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1506  ribonuclease  41.54 
 
 		 490 aa  300  9e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0158  ribonuclease G  42.68 
 
 		 497 aa  299  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  41.29 
 
 		 489 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002988  ribonuclease E  38.26 
 
 		 1024 aa  298  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  39.95 
 
 		 501 aa  298  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1040  ribonuclease E protein  37.89 
 
 		 1014 aa  297  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2504  ribonuclease  38.2 
 
 		 1084 aa  297  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4339  ribonuclease, Rne/Rng family  41.83 
 
 		 411 aa  297  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260891  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  41.25 
 
 		 489 aa  296  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  39.95 
 
 		 496 aa  296  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  39.29 
 
 		 503 aa  296  9e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1989  ribonuclease E  37.68 
 
 		 1141 aa  296  9e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.378047  normal  0.0201653 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  41.46 
 
 		 497 aa  296  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  40.19 
 
 		 517 aa  296  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1615  ribonuclease E  39.13 
 
 		 688 aa  296  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120942  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1190  ribonuclease, Rne/Rng family  38.2 
 
 		 938 aa  296  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.048961  normal  0.116022 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0541  ribonuclease, Rne/Rng family  38 
 
 		 515 aa  295  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.353694 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  40.38 
 
 		 500 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000845474  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  41 
 
 		 489 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0818  ribonuclease  38.19 
 
 		 1092 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00158382  normal  0.513461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2032  ribonuclease  37.96 
 
 		 1142 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.390229  normal  0.144876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2785  ribonuclease E  38.31 
 
 		 1088 aa  295  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  41.46 
 
 		 497 aa  294  3e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2220  ribonuclease, Rne/Rng family  39.02 
 
 		 782 aa  295  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1874  ribonuclease, Rne/Rng family  39.02 
 
 		 782 aa  295  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000717737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0389  ribonuclease  38.37 
 
 		 879 aa  295  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.57215  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1573  ribonuclease  37.12 
 
 		 1128 aa  294  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2193  ribonuclease  37.94 
 
 		 1111 aa  294  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695078  normal  0.0536966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  37.59 
 
 		 1056 aa  294  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  39.9 
 
 		 495 aa  294  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0396  ribonuclease, Rne/Rng family  38.13 
 
 		 865 aa  294  5e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2233  ribonuclease E  37.83 
 
 		 1015 aa  293  6e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.893079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0991  ribonuclease  37.77 
 
 		 1059 aa  293  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2302  ribonuclease  37.11 
 
 		 1102 aa  293  7e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275092  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1490  ribonuclease, Rne/Rng family protein  37.83 
 
 		 1124 aa  293  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.326409  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  39.9 
 
 		 495 aa  293  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2405  RNAse E  37.83 
 
 		 1093 aa  293  9e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.133315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  37.71 
 
 		 1053 aa  292  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1062  ribonuclease E  37.95 
 
 		 1096 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  0.00000580995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2475  RNAse E  38.07 
 
 		 1095 aa  293  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.350754  normal  0.0309861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2567  RNAse E  37.83 
 
 		 1098 aa  292  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2208  ribonuclease, Rne/Rng family protein  38.31 
 
 		 1065 aa  293  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2863  ribonuclease E  37.77 
 
 		 1088 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.829315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>