More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5386 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
355 aa  712    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  86.72 
 
 
241 aa  424  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  49.27 
 
 
265 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  56.73 
 
 
265 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  53.47 
 
 
246 aa  206  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0104  Methyltransferase type 11  56.67 
 
 
260 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  60.45 
 
 
276 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3422  transcriptional regulator, ArsR family  88.18 
 
 
110 aa  202  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.636226  normal  0.0872067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  58.76 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  55.71 
 
 
267 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  60.45 
 
 
283 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  57.53 
 
 
256 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  50 
 
 
270 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  52.49 
 
 
276 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  53.04 
 
 
282 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  52.43 
 
 
263 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  43.63 
 
 
263 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.16 
 
 
266 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  44.5 
 
 
280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  43.75 
 
 
277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  43.68 
 
 
277 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  44.15 
 
 
264 aa  157  3e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  46.67 
 
 
262 aa  156  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  43 
 
 
268 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  44.51 
 
 
279 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.04 
 
 
265 aa  153  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  46.45 
 
 
274 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  41.06 
 
 
266 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  45.21 
 
 
295 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  42.86 
 
 
272 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  47.59 
 
 
267 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  49.71 
 
 
237 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2283  transcriptional regulator, ArsR family  64.42 
 
 
116 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  43.65 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  42.57 
 
 
288 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  37.97 
 
 
282 aa  146  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  43.18 
 
 
248 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  42.26 
 
 
267 aa  142  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 
298 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  42.31 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.45 
 
 
279 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  42.77 
 
 
1014 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.78 
 
 
280 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0073  ArsR family transcriptional regulator  59.18 
 
 
110 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.77483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  38.59 
 
 
280 aa  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  35.96 
 
 
239 aa  119  6e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8615  transcriptional regulator, ArsR family  58.16 
 
 
113 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00863901  normal  0.187471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  37.02 
 
 
1000 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  39.66 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
409 aa  112  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  38.16 
 
 
209 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  36.16 
 
 
258 aa  109  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  34.09 
 
 
1005 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  35.27 
 
 
1039 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
1002 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1418  methyltransferase type 11  32.51 
 
 
379 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.685062  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4114  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 
365 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.199074  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  39.31 
 
 
216 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04141  putative methyltransferase  34.74 
 
 
241 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4075  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 
365 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0411  hypothetical protein  32.99 
 
 
264 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0624483  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3607  Methyltransferase type 11  28.11 
 
 
307 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.289928  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04771  putative methyltransferase  32.47 
 
 
264 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1636  methyltransferase type 11  39.86 
 
 
261 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  32.83 
 
 
267 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25654  predicted protein  37.38 
 
 
200 aa  97.4  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  41.45 
 
 
204 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04351  putative methyltransferase  30.2 
 
 
264 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
261 aa  96.7  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04661  putative methyltransferase  33.33 
 
 
264 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  36.31 
 
 
259 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  36.16 
 
 
350 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28006  predicted protein  34.76 
 
 
418 aa  93.2  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.122244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2227  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 
396 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372982 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  34.72 
 
 
266 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  34.88 
 
 
262 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4493  transcriptional regulator, ArsR family  44.95 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1984  methyltransferase-like  33.68 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  35.75 
 
 
350 aa  89.7  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.85 
 
 
356 aa  89.4  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  28.71 
 
 
310 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  38.55 
 
 
369 aa  89  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0301  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
380 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1991  methyltransferase type 11  30.45 
 
 
411 aa  87  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1914  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 
324 aa  86.3  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  40.83 
 
 
415 aa  86.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3308  methyltransferase type 11  41.79 
 
 
239 aa  86.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.16 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  29.65 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  26.39 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  32.76 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  27.3 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  36.9 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  28.25 
 
 
305 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  33.88 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>