20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5374 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5374  Alkylmercury lyase  100 
 
 
216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4512  alkylmercury lyase  43.46 
 
 
221 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0148177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3214  alkylmercury lyase  42.22 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00854121  normal  0.424714 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25630  alkylmercury lyase  42.94 
 
 
227 aa  142  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0164  alkylmercury lyase  41.32 
 
 
212 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.581292  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0319  alkylmercury lyase  37.3 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0243  alkylmercury lyase  37.35 
 
 
211 aa  117  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02948  alkylmercury lyase  37.95 
 
 
211 aa  118  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597593  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2647  Alkylmercury lyase  42.42 
 
 
213 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2330  alkylmercury lyase  28.74 
 
 
215 aa  86.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0726495  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2197  alkylmercury lyase  28.77 
 
 
317 aa  61.6  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4942  alkylmercury lyase  28.33 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0286842  normal  0.02099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  29.17 
 
 
767 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  31.33 
 
 
767 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0322  hypothetical protein  38.82 
 
 
100 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  30.33 
 
 
745 aa  54.7  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5375  alkylmercury lyase  27.01 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3948  hypothetical protein  35.44 
 
 
193 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.187867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1769  alkylmercury lyase  28.14 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1768  alkylmercury lyase  26.83 
 
 
190 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.628119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>