More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5221 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  52.56 
 
 		 243 aa  204  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  47.64 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4720  transcriptional regulator, GntR family  50 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 234 aa  101  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  35.03 
 
 		 227 aa  98.2  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 233 aa  98.6  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.36 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 240 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.36 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  33.99 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 222 aa  95.9  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  32.23 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 235 aa  94  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 229 aa  93.2  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 233 aa  92  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  32.35 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 240 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  28.65 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  31.38 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 233 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 237 aa  85.5  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4215  transcriptional regulator, GntR family  32.46 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162899  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4045  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.48 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  33.87 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 256 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4366  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0649  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.875188  normal  0.130581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>