280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5198 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
278 aa  567  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  53.28 
 
 
286 aa  267  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.53 
 
 
278 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.47 
 
 
289 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.43 
 
 
271 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.66 
 
 
244 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.73 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  39.09 
 
 
316 aa  109  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.41 
 
 
242 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.76 
 
 
242 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.27 
 
 
639 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.18 
 
 
591 aa  102  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.57 
 
 
639 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.6 
 
 
236 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.46 
 
 
298 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.44 
 
 
246 aa  99.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.44 
 
 
246 aa  99.8  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
242 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.89 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.92 
 
 
837 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.87 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.23 
 
 
281 aa  96.3  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.07 
 
 
283 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.48 
 
 
644 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.3 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.85 
 
 
808 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.91 
 
 
634 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.77 
 
 
300 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.8 
 
 
282 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  29.2 
 
 
673 aa  86.3  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.97 
 
 
283 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.4 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 
228 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.4 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 
260 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.68 
 
 
576 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.95 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.5 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.65 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.25 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.25 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.43 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.6 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.36 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  30.98 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.88 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.64 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.86 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.8 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.8 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.8 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  26.34 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  29.01 
 
 
286 aa  76.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.8 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.95 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.72 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.2 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.87 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  28.06 
 
 
657 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.79 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.69 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.12 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.9 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.94 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2228  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.34 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.37 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.79 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.3 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  27.24 
 
 
617 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.95 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350.1  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.36 
 
 
324 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0665906  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.1 
 
 
250 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.95 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.59 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.37 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.76 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.76 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  32.22 
 
 
338 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2361  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.14 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.46 
 
 
233 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1114  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.14 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.04 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.66 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.14 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187821  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1174  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.93 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834262  normal  0.168848 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2196  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.14 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0055  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.14 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.91 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.81 
 
 
1153 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.21 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3678  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.28 
 
 
437 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.322426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.41 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 
271 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>