54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5164 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5164  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 		 301 aa  566  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4082  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  41.49 
 
 		 250 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3702  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  40.64 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.512385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.02 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882429 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.27 
 
 		 248 aa  85.9  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6698  sirohydrochlorin cobaltochelatase  34.03 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99079  normal  0.371849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  46.28 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  decreased coverage  0.000000457043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2348  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  51.85 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511172  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1785  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.45 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0615189  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2247  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.46 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.0131126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2817  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.34 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3504  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.04 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  34.75 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1890  putative secreted protein  57.14 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18840  uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.27 
 
 		 515 aa  69.7  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00867929  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12421  hypothetical protein  30.63 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0300  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  40.18 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.46 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2684  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.68 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.92 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3126  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  44.9 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2421  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.21 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0381  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  40.94 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00853901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5921  hypothetical protein  39.29 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.49 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3539  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.49 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00880  hypothetical protein  41.49 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1776  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  42.98 
 
 		 245 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.324205  normal  0.011171 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2821  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.79 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0841  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.33 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000619723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3489  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.11 
 
 		 234 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09950  hypothetical protein  42.74 
 
 		 249 aa  53.5  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640484  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0252  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  45.54 
 
 		 231 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0272  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  45.54 
 
 		 231 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.243812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0262  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  45.54 
 
 		 231 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.69 
 
 		 553 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2795  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.6 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.048407  hitchhiker  0.00112635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1128  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.93 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1812  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  41.18 
 
 		 249 aa  50.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10263  hypothetical protein  36.67 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.826629  normal  0.120754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4371  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.74 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3170  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.46 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.803624  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.36 
 
 		 550 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3536  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.31 
 
 		 137 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.15 
 
 		 357 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  22.92 
 
 		 275 aa  46.2  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2078  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  41.18 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3859  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  40.51 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72846  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5277  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.35 
 
 		 126 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1626  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.28 
 
 		 531 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1567  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.05 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1320  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  51.11 
 
 		 326 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0423235  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0171  sirohydrochlorin cobaltochelatase  25.08 
 
 		 416 aa  42.7  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2430  hypothetical protein  34.94 
 
 		 229 aa  42.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>