More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5131 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  100 
 
 
301 aa  607  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  66.11 
 
 
300 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  54.61 
 
 
756 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  53.85 
 
 
741 aa  312  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  52.2 
 
 
308 aa  298  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  52.38 
 
 
303 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  51.3 
 
 
319 aa  293  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6085  ABC transporter related  49.83 
 
 
312 aa  288  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  47.52 
 
 
304 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  42.26 
 
 
310 aa  246  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
303 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 
305 aa  245  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  44.66 
 
 
305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
305 aa  242  5e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  44.85 
 
 
310 aa  242  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  42.62 
 
 
305 aa  241  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  47.51 
 
 
306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  42.28 
 
 
301 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  39.94 
 
 
308 aa  238  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  41.84 
 
 
283 aa  235  9e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  42.14 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  42.86 
 
 
295 aa  230  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  41.35 
 
 
326 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  44.12 
 
 
311 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  43.14 
 
 
312 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  44.48 
 
 
285 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  44.77 
 
 
300 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  47.96 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  41.56 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  44.78 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  43.88 
 
 
293 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  43.05 
 
 
282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  41.75 
 
 
326 aa  218  7.999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  54.03 
 
 
322 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  44.97 
 
 
302 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  42.38 
 
 
293 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.13 
 
 
339 aa  217  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  43.46 
 
 
311 aa  216  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  39.07 
 
 
294 aa  215  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  42.19 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  41.12 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  47.95 
 
 
256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  44 
 
 
330 aa  212  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  44.94 
 
 
313 aa  212  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  36.27 
 
 
310 aa  212  7e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  43.93 
 
 
308 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  41.69 
 
 
290 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  45.85 
 
 
299 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.35 
 
 
329 aa  210  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 
280 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  38.39 
 
 
305 aa  210  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  40.51 
 
 
323 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  40.82 
 
 
284 aa  209  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  43.92 
 
 
317 aa  208  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  42.95 
 
 
329 aa  209  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
302 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  42.54 
 
 
314 aa  208  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  43.29 
 
 
301 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  36.72 
 
 
312 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  44.82 
 
 
374 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  40.8 
 
 
284 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  39.61 
 
 
327 aa  208  1e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  40 
 
 
303 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  43.29 
 
 
301 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  43.69 
 
 
322 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  41.88 
 
 
322 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  43.32 
 
 
308 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  46.03 
 
 
308 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  42.81 
 
 
309 aa  205  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
312 aa  205  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 
312 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 
312 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
312 aa  205  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 
312 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0563  ABC transporter related  40.13 
 
 
311 aa  205  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
312 aa  205  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  43.83 
 
 
331 aa  205  8e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.04 
 
 
312 aa  205  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  35.56 
 
 
312 aa  205  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  38.14 
 
 
309 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  39.4 
 
 
321 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
312 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  41.53 
 
 
310 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  43.17 
 
 
290 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10710  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.96 
 
 
316 aa  204  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  39.34 
 
 
310 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  40.33 
 
 
304 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  42.76 
 
 
315 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
312 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 
330 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.94 
 
 
308 aa  203  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  36.51 
 
 
311 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.74 
 
 
317 aa  203  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  36.04 
 
 
313 aa  203  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  42.37 
 
 
276 aa  202  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.92 
 
 
313 aa  202  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.26 
 
 
316 aa  202  5e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  43.85 
 
 
310 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  43.85 
 
 
310 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  43.85 
 
 
310 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>