16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4935 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4935  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3405  hypothetical protein  36.27 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2657  hypothetical protein  33.47 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00775221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0175  hypothetical protein  33.5 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0933557  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01020  hypothetical protein  28.65 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1109  hypothetical protein  27.48 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182239  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0086  hypothetical protein  30.64 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4368  hypothetical protein  27.67 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0174  hypothetical protein  29.22 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0142  hypothetical protein  30.77 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5476  hypothetical protein  29.61 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1144  hypothetical protein  23.33 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437754  normal  0.0600359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5035  hypothetical protein  24.86 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5123  hypothetical protein  24.86 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5416  hypothetical protein  24.83 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13873  hypothetical protein  26.9 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>