65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4924 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 193 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  41.58 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  36.41 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 192 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  35.67 
 
 		 230 aa  88.6  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  32.26 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  37.27 
 
 		 213 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  31.94 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  31.94 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  31.58 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  35.52 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  31.69 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.97 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  29.38 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  31.77 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  33.51 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.42 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  30.3 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  33.15 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  35.4 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  30.43 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  29.59 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  30.91 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  38.85 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  28.02 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  28.11 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  28.34 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  26.09 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  28.07 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  33.53 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1838  transcriptional regulator, ArsR family  27.84 
 
 		 472 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.240001  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4756  transcriptional regulator, ArsR family  26.28 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00171627  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  51.85 
 
 		 117 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  38.98 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 102 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2713  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 		 102 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2808  transcriptional regulator, ArsR family  45.59 
 
 		 101 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.598578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  38.46 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  35.14 
 
 		 107 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 183 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 107 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4493  transcriptional regulator, ArsR family  47.54 
 
 		 302 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1506  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 94 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  48 
 
 		 118 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 240 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 107 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 107 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.62 
 
 		 105 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0148  ArsR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 91 aa  42  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  42 
 
 		 119 aa  41.6  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1526  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 180 aa  41.6  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2379  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 485 aa  41.6  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 109 aa  41.6  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3120  ArsR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 88 aa  41.2  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127966  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 107 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.21 
 
 		 106 aa  41.2  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>