More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4922 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 410 aa  818    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  58.02 
 
 		 419 aa  435  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  55.91 
 
 		 419 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  53.27 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  56.07 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  52.76 
 
 		 424 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  53.85 
 
 		 410 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  54.9 
 
 		 422 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  53.94 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3213  DNA-directed DNA polymerase  54.34 
 
 		 407 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0704877  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  52.45 
 
 		 402 aa  364  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  51.69 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  52.74 
 
 		 414 aa  363  4e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  51.57 
 
 		 420 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  49.74 
 
 		 408 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  49.74 
 
 		 408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  49.13 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  50.74 
 
 		 415 aa  348  8e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16030  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  49.48 
 
 		 407 aa  340  4e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.0704551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1063  DNA-directed DNA polymerase  46.49 
 
 		 413 aa  300  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.435169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  40.62 
 
 		 393 aa  297  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  47.16 
 
 		 409 aa  292  6e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  42.78 
 
 		 408 aa  292  8e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  44.24 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  40.16 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  48.41 
 
 		 466 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  47.23 
 
 		 418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13710  DNA polymerase IV involved in DNA repair  45.18 
 
 		 431 aa  281  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  40.8 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  46.65 
 
 		 418 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  46.65 
 
 		 418 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  46.2 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  39.85 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  41.73 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  45.07 
 
 		 834 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  40.05 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  40.05 
 
 		 409 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  39.74 
 
 		 426 aa  270  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  44.57 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  40.16 
 
 		 408 aa  265  8e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  44.41 
 
 		 380 aa  265  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  44.82 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  44.65 
 
 		 385 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  43.92 
 
 		 378 aa  262  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  43.08 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  45.08 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  45.08 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  42.31 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  42.29 
 
 		 436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  38.32 
 
 		 397 aa  259  6e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  43.56 
 
 		 424 aa  259  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  37.79 
 
 		 409 aa  259  9e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  38.85 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  39.14 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  43.8 
 
 		 413 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  41.39 
 
 		 402 aa  257  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  45.86 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  43.36 
 
 		 359 aa  257  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  42.14 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  41.13 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  37.4 
 
 		 395 aa  256  4e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  43.52 
 
 		 378 aa  256  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  43.67 
 
 		 481 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  40.05 
 
 		 412 aa  256  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  39.18 
 
 		 413 aa  255  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  37.8 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  40.36 
 
 		 384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  45.45 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  39.79 
 
 		 431 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  40.27 
 
 		 436 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  40.57 
 
 		 430 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3609  DNA-directed DNA polymerase  41.75 
 
 		 405 aa  252  9.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  44.25 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  42.14 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  38.07 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1686  Nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  35.48 
 
 		 424 aa  250  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  42.11 
 
 		 365 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  41.84 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  38.6 
 
 		 407 aa  249  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  40 
 
 		 431 aa  249  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  44.97 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  38.12 
 
 		 359 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  40.95 
 
 		 363 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  36.81 
 
 		 410 aa  246  6e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  43.84 
 
 		 381 aa  245  9e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  43.31 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  43.31 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  39.62 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  39.3 
 
 		 429 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  42.05 
 
 		 432 aa  243  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  39.58 
 
 		 354 aa  243  6e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  35.99 
 
 		 411 aa  243  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2975  DNA polymerase IV  44.01 
 
 		 443 aa  243  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.949481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  39.42 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3810  DNA polymerase IV  38.87 
 
 		 428 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0803828  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  39.73 
 
 		 453 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  40.95 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  39.59 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  38.02 
 
 		 410 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  43.63 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>