More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4899 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4899  histidine kinase  100 
 
 
583 aa  1129    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.597043  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.11 
 
 
494 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205358  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  47.31 
 
 
475 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 
534 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  45.77 
 
 
498 aa  347  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 
513 aa  342  1e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  44.99 
 
 
508 aa  324  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2439  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 
537 aa  313  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230044  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4934  histidine kinase  44.73 
 
 
515 aa  308  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  36.65 
 
 
491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  36.23 
 
 
507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  40.21 
 
 
555 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4259  ATP-binding region ATPase domain protein  43.78 
 
 
508 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0361398  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  37.86 
 
 
469 aa  294  4e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3166  histidine kinase  43.13 
 
 
517 aa  293  7e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
501 aa  290  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.414231  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2684  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 
513 aa  270  5e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2868  histidine kinase  36.65 
 
 
516 aa  243  7e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02950  signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
544 aa  236  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7131  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.34 
 
 
521 aa  234  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.1 
 
 
504 aa  183  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
438 aa  178  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
469 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  38.18 
 
 
477 aa  171  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  33.07 
 
 
520 aa  171  5e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  38.78 
 
 
490 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.88 
 
 
452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
490 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 
509 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.26 
 
 
469 aa  157  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
504 aa  157  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
515 aa  155  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
469 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  34.01 
 
 
503 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
524 aa  153  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
470 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
458 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2241  sensor histidine kinase  30.54 
 
 
452 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5912199999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2057  sensor histidine kinase  30.54 
 
 
452 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.38 
 
 
457 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2213  sensor histidine kinase  30.54 
 
 
452 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.65 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  35.58 
 
 
506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  32.03 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2195  sensor histidine kinase  29.64 
 
 
452 aa  148  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00104327  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 
482 aa  148  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  33.24 
 
 
496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  32.31 
 
 
470 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
545 aa  146  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.02 
 
 
486 aa  146  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
455 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  37.24 
 
 
436 aa  145  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0452  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
477 aa  144  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5177  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
468 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.477019  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  28.95 
 
 
463 aa  144  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  33.59 
 
 
497 aa  143  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  28.36 
 
 
461 aa  143  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  30.45 
 
 
471 aa  143  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  30.25 
 
 
465 aa  143  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
447 aa  143  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  33.03 
 
 
463 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
469 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4258  histidine kinase  33.24 
 
 
529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432696  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  31.7 
 
 
559 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  37.63 
 
 
454 aa  141  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
487 aa  142  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
480 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
362 aa  140  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
459 aa  140  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  35.31 
 
 
481 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 
474 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1460  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
461 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
460 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
475 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
513 aa  138  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 
524 aa  139  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  28.7 
 
 
463 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  36.04 
 
 
469 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28.07 
 
 
456 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  30.58 
 
 
472 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0020  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426505  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0018  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 
468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  27.78 
 
 
463 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
505 aa  137  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
483 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
474 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
475 aa  137  5e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  33.66 
 
 
477 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1624  sensor histidine kinase CsrS  32.07 
 
 
501 aa  137  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0265731  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
478 aa  137  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  28.07 
 
 
463 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  28.07 
 
 
463 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  30.72 
 
 
471 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  35.74 
 
 
480 aa  136  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
465 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5384  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
469 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.951659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  35.59 
 
 
459 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
460 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>