More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4835 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  100 
 
 		 414 aa  830    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  44.29 
 
 		 379 aa  299  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  46.43 
 
 		 399 aa  288  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1402  putative two-component system sensor kinase  40.93 
 
 		 407 aa  227  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2226  histidine kinase  40.53 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0337  histidine kinase  36.2 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1875  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 372 aa  160  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0572952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.68 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0184  regulatory protein LuxR  36.97 
 
 		 489 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  43.5 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  31.92 
 
 		 423 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  30.15 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 394 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  39 
 
 		 395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2657  histidine kinase  39.29 
 
 		 426 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 403 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  31.11 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  39.51 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16990  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.566842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  33.51 
 
 		 442 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  41.04 
 
 		 392 aa  126  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.82 
 
 		 370 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  40 
 
 		 372 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 536 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  32.87 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  33.6 
 
 		 408 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  38.08 
 
 		 417 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  32.5 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  39.13 
 
 		 428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  37.34 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  34.6 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  30 
 
 		 397 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.66 
 
 		 567 aa  119  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  38.72 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  34.8 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  38.57 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  34.59 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  30.97 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  36.61 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  31.69 
 
 		 422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  36.03 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 416 aa  116  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  31.73 
 
 		 478 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 424 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.41 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  38.5 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  30.47 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000231241 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  36.82 
 
 		 445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  34.33 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  37.07 
 
 		 380 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  34.14 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  42.24 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  36.22 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  34.46 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 444 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.83 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 445 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  34.62 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.29 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  36.29 
 
 		 407 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  36.2 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  34.5 
 
 		 430 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2731  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  29.2 
 
 		 367 aa  109  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810003  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 404 aa  109  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  35.17 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.18 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.33 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2467  histidine kinase  36.67 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 439 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 445 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  40.69 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  34.12 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  34.26 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  34.73 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  33.48 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  37.44 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  35.03 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  37.61 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  37.98 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  38.05 
 
 		 380 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3178  histidine kinase  29.56 
 
 		 430 aa  107  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 392 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2252  histidine kinase  34.36 
 
 		 386 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  33.33 
 
 		 395 aa  106  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.74 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>