297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4815 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  100 
 
 
137 aa  276  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  66.67 
 
 
370 aa  181  4e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.75954e-05  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  68.46 
 
 
391 aa  178  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  66.67 
 
 
383 aa  168  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  63.64 
 
 
369 aa  163  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  70.09 
 
 
412 aa  162  2e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  62.41 
 
 
363 aa  160  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  61.65 
 
 
365 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  61.65 
 
 
365 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  61.65 
 
 
365 aa  158  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  59.85 
 
 
356 aa  157  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  62.69 
 
 
440 aa  157  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  61.54 
 
 
378 aa  155  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  60.31 
 
 
401 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  63.16 
 
 
378 aa  147  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  61.11 
 
 
364 aa  147  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  61.65 
 
 
411 aa  147  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  61.54 
 
 
378 aa  144  4e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  70.94 
 
 
402 aa  143  7e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  59.56 
 
 
452 aa  143  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  57.89 
 
 
382 aa  143  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  60 
 
 
427 aa  139  1e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  61.6 
 
 
366 aa  134  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  60.61 
 
 
412 aa  132  2e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  58.59 
 
 
322 aa  129  1e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  48.44 
 
 
211 aa  117  4e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  47.58 
 
 
253 aa  116  1e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  47.58 
 
 
253 aa  116  1e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  44.88 
 
 
313 aa  115  2e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  48.09 
 
 
133 aa  114  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  46.77 
 
 
168 aa  114  4e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  45.9 
 
 
198 aa  112  1e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  45.97 
 
 
254 aa  110  4e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  48.8 
 
 
132 aa  109  1e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  42.75 
 
 
194 aa  108  2e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  46.83 
 
 
197 aa  104  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  41.18 
 
 
142 aa  100  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  37.69 
 
 
134 aa  98.2  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  42.19 
 
 
126 aa  92  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  42.4 
 
 
197 aa  92.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  44.09 
 
 
198 aa  91.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  36.15 
 
 
154 aa  91.3  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  45.6 
 
 
197 aa  90.5  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  40.5 
 
 
199 aa  81.3  4e-15  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  42.97 
 
 
198 aa  80.9  5e-15  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  44.87 
 
 
81 aa  79.3  2e-14  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  37.4 
 
 
216 aa  78.2  3e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  37.7 
 
 
187 aa  76.3  1e-13  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  36.89 
 
 
187 aa  75.9  2e-13  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  38.46 
 
 
376 aa  75.5  2e-13  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  39.42 
 
 
139 aa  75.1  3e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  39.56 
 
 
148 aa  74.7  4e-13  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  39.85 
 
 
154 aa  73.9  7e-13  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  37.3 
 
 
145 aa  72  3e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  34.92 
 
 
128 aa  71.6  3e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  34.4 
 
 
128 aa  70.9  6e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  34.4 
 
 
128 aa  70.9  6e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  34.4 
 
 
128 aa  70.9  6e-12  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  40.77 
 
 
149 aa  70.9  6e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  34.4 
 
 
128 aa  70.9  6e-12  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  34.4 
 
 
128 aa  70.9  6e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  34.4 
 
 
128 aa  70.9  6e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  34.4 
 
 
128 aa  70.5  7e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  33.6 
 
 
128 aa  69.3  2e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  33.6 
 
 
128 aa  69.3  2e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  29.6 
 
 
133 aa  66.2  1e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  29.6 
 
 
133 aa  66.2  1e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  31.2 
 
 
132 aa  65.1  3e-10  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3678  ribonuclease H  35.38 
 
 
217 aa  64.7  4e-10  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  30.47 
 
 
131 aa  63.5  9e-10  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  32.82 
 
 
154 aa  63.5  1e-09  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  31.39 
 
 
152 aa  62.4  2e-09  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1544  ribonuclease H  36.3 
 
 
217 aa  62.4  2e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2382  ribonuclease H  36.09 
 
 
209 aa  62.8  2e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.227808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1325  hypothetical protein  30.4 
 
 
417 aa  61.6  3e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1354  Ribonuclease HI-like protein  30.4 
 
 
417 aa  61.6  3e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384272  hitchhiker  7.13582e-07 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  34.42 
 
 
161 aa  61.2  4e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.69175e-08 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  35.81 
 
 
170 aa  61.6  4e-09  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  35.29 
 
 
215 aa  61.6  4e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  30.14 
 
 
159 aa  60.5  8e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  4.08734e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2875  ribonuclease H  35.56 
 
 
220 aa  59.7  1e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.542501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5115  hypothetical protein  31.58 
 
 
388 aa  59.3  2e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.503544 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  33.61 
 
 
142 aa  59.3  2e-08  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4709  ribonuclease H  40.7 
 
 
236 aa  59.3  2e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  33.12 
 
 
150 aa  58.5  3e-08  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8140  ribonuclease H  34.4 
 
 
242 aa  57.4  7e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  29.71 
 
 
159 aa  57.4  7e-08  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  35.48 
 
 
153 aa  57  8e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  33.33 
 
 
241 aa  56.6  1e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  5.26772e-05  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0852  ribonuclease H  34.25 
 
 
164 aa  55.8  2e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  33.33 
 
 
148 aa  54.3  5e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  33.99 
 
 
164 aa  54.3  5e-07  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2382  ribonuclease H  33.77 
 
 
158 aa  54.3  6e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  31.51 
 
 
145 aa  54.3  6e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1680  ribonuclease H  33.33 
 
 
161 aa  53.9  7e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.254579  normal  0.760209 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0205  ribonuclease H  30.43 
 
 
118 aa  53.9  8e-07  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  31.69 
 
 
151 aa  53.9  8e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1985  ribonuclease H  31.43 
 
 
230 aa  53.5  9e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.02134e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2527  RNase HI  34.03 
 
 
150 aa  53.5  1e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2969  Ribonuclease H  30.6 
 
 
157 aa  53.5  1e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>