More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4726 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  100 
 
 		 405 aa  793    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.23 
 
 		 386 aa  282  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  43 
 
 		 410 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  44.69 
 
 		 420 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.91 
 
 		 405 aa  246  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  44.39 
 
 		 389 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.15 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  37.87 
 
 		 433 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  36.67 
 
 		 442 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.13 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  39.8 
 
 		 429 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.86 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  42.05 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  43.03 
 
 		 463 aa  212  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  50.44 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  39.94 
 
 		 430 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 		 422 aa  207  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  42.02 
 
 		 452 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.18 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  47.79 
 
 		 489 aa  202  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  37.41 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.49 
 
 		 343 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  47.09 
 
 		 416 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  42.58 
 
 		 426 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.17 
 
 		 415 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 		 375 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.1 
 
 		 508 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.41 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  40.91 
 
 		 383 aa  187  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  39.69 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 		 586 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.83 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 		 438 aa  176  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  35.75 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  44.39 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.44 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  43.02 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.21 
 
 		 435 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  35.79 
 
 		 438 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  36.28 
 
 		 434 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  45.98 
 
 		 402 aa  169  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.66 
 
 		 432 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  34.86 
 
 		 439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 465 aa  163  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  51.38 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 492 aa  156  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  44.13 
 
 		 429 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  35.17 
 
 		 446 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  43.81 
 
 		 374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  44.96 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  43.09 
 
 		 476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 624 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 		 326 aa  146  6e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 388 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 466 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.88 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 447 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 621 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  46.54 
 
 		 454 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.76 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 		 570 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 382 aa  132  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  40.47 
 
 		 580 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 587 aa  120  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  33.95 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  33.63 
 
 		 687 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  36.32 
 
 		 237 aa  107  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 		 725 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  37.32 
 
 		 720 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 594 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  37.31 
 
 		 664 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  36.82 
 
 		 365 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  34.77 
 
 		 650 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  38.97 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 576 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 565 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  36.61 
 
 		 686 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  34.39 
 
 		 368 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 709 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  37.5 
 
 		 451 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  31.68 
 
 		 689 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 447 aa  95.9  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>