67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4706 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4706  gas vesicle protein GVPa  100 
 
 		 138 aa  275  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.783958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6855  hypothetical protein  67.24 
 
 		 137 aa  140  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2356  gas vesicle protein GVPa  52.99 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0939575 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2381  gas vesicle synthesis-like protein  52.59 
 
 		 139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.528325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2375  gas vesicle synthesis-like protein  52.59 
 
 		 139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.721458  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2334  gas vesicle synthesis-like protein  52.59 
 
 		 139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3382  gas vesicle protein GVPa  64.71 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0355765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4008  gas vesicle synthesis-like protein  53.6 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1006  gas vesicle synthesis-like protein  56.19 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1253  gas vesicle synthesis protein GvpA  75.47 
 
 		 72 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.13379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0078  gas vesicle synthesis protein GvpA  72.73 
 
 		 71 aa  83.6  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00750449  normal  0.0121047 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2325  gas vesicle synthesis protein GvpA  72.73 
 
 		 72 aa  83.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740835  unclonable  0.0000203995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0079  gas vesicle synthesis protein GvpA  70.91 
 
 		 71 aa  82.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.0117948 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1748  gas vesicle synthesis protein GvpA  71.7 
 
 		 72 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2324  gas vesicle synthesis protein GvpA  69.09 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000112837  hitchhiker  0.000242369 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3114  gas vesicle protein GVPa  48.86 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2374  gas vesicle protein GVPa  60 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0334  gas vesicle protein GVPa  52.11 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1818  gas vesicle synthesis protein GvpA  68.52 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1819  gas vesicle synthesis protein GvpA  68.52 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075778  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1820  gas vesicle synthesis protein GvpA  68.52 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000245848  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1821  gas vesicle synthesis protein GvpA  68.52 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0689  gas vesicle synthesis protein GvpA  68.52 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.021084  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0688  gas vesicle synthesis protein GvpA  68.52 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0200953  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2839  gas vesicle synthesis protein GvpA  67.27 
 
 		 72 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0327  gas vesicle synthesis protein GvpA  51.47 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.516569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0326  gas vesicle synthesis protein GvpA  51.47 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0328  gas vesicle synthesis protein GvpA  51.47 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.518273 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0686  gas vesicle synthesis protein GvpA  66.67 
 
 		 68 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0189096  normal  0.509379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3016  gas vesicle protein GVPa  65.45 
 
 		 71 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2404  gas vesicle protein GVPa  62.71 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3573  gas vesicle synthesis protein GvpA  61.82 
 
 		 70 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3255  gas vesicle synthesis protein GvpA  61.82 
 
 		 70 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0063  gas vesicle synthesis protein GvpA  54.24 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0062  gas vesicle synthesis protein GvpA  54.24 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0061  gas vesicle synthesis protein GvpA  54.24 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0060  gas vesicle synthesis protein GvpA  54.24 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.537884  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1499  gas vesicle protein GVPa  65.45 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1498  gas vesicle protein GVPa  65.45 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.921273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  63.83 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2323  gas vesicle protein GVPa  57.78 
 
 		 54 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000151045  hitchhiker  0.000256299 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3264  gas vesicle protein GVPa  59.62 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800769  normal  0.701046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  47.54 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2379  gas vesicle protein GVPa  54.24 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3386  gas vesicle protein GVPa  47.69 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.128813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2338  gas vesicle protein GVPa  54.24 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2385  gas vesicle protein GVPa  54.24 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.14946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  43.08 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  36.9 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3025  gas vesicle protein GVPa  51.06 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.749024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2369  gas vesicle protein GVPa  31.15 
 
 		 201 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  33.85 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0070  gas vesicle protein GVPa  49.06 
 
 		 126 aa  50.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0339  gas vesicle protein GVPa  36.67 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  48.89 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  46.67 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0335  hypothetical protein  48.94 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.942024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2828  gas vesicle protein GVPa  47.06 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  50 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  37.74 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  41.67 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2825  gas vesicle protein GVPa  41.3 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1489  gas vesicle protein GVPa  43.48 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.510909  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1485  gas vesicle protein GVPa  40.43 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0249757  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  51.22 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2322  gas vesicle protein GVPa  62.86 
 
 		 62 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000661358  hitchhiker  0.000258705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>