176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4670 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 
899 aa  1834    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  42.8 
 
 
961 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  41.98 
 
 
986 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  41.98 
 
 
955 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  41.98 
 
 
955 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  41.98 
 
 
986 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  41.98 
 
 
986 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  42.12 
 
 
986 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  41.98 
 
 
986 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  41.9 
 
 
964 aa  525  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  38.97 
 
 
827 aa  501  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  37.32 
 
 
1084 aa  488  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  39.64 
 
 
1189 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  38.45 
 
 
823 aa  465  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  38.83 
 
 
877 aa  463  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  38.13 
 
 
1075 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  38.43 
 
 
819 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  38.43 
 
 
819 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  38.43 
 
 
819 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  35.71 
 
 
1089 aa  458  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  37.96 
 
 
811 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  37.03 
 
 
890 aa  412  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.25 
 
 
846 aa  402  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.67 
 
 
807 aa  402  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.07 
 
 
849 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  35.16 
 
 
784 aa  391  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  33.21 
 
 
839 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  33.63 
 
 
785 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  34.42 
 
 
821 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.58 
 
 
784 aa  371  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  41.07 
 
 
1465 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  31.7 
 
 
775 aa  362  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  33.2 
 
 
773 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  30.89 
 
 
753 aa  352  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  32.52 
 
 
759 aa  352  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  31.68 
 
 
976 aa  351  3e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5720  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.76 
 
 
900 aa  351  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0689456  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6084  putative alpha-1,2-mannosidase  32.76 
 
 
900 aa  351  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  30.99 
 
 
762 aa  349  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  31.57 
 
 
745 aa  346  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  32.3 
 
 
747 aa  345  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  32.58 
 
 
777 aa  344  4e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  32.68 
 
 
740 aa  340  5e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  31.34 
 
 
747 aa  338  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  30.23 
 
 
769 aa  335  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  30.68 
 
 
761 aa  332  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  33.2 
 
 
742 aa  333  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  31.53 
 
 
771 aa  331  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  31.15 
 
 
757 aa  331  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.49 
 
 
771 aa  330  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  30.01 
 
 
754 aa  327  4.0000000000000003e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  33.33 
 
 
790 aa  327  9e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  29.44 
 
 
778 aa  326  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  33.15 
 
 
790 aa  326  1e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7541  Alpha-1,2-mannosidase, putative  31.87 
 
 
900 aa  324  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.439325 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  31.18 
 
 
760 aa  324  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  34.06 
 
 
754 aa  324  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  29.18 
 
 
749 aa  322  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.2 
 
 
771 aa  315  3.9999999999999997e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  32.74 
 
 
751 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  29.51 
 
 
774 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  28.61 
 
 
795 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  29.59 
 
 
772 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  33.97 
 
 
769 aa  303  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  29.49 
 
 
706 aa  301  5e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  29.81 
 
 
782 aa  300  8e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  29.41 
 
 
758 aa  300  9e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  29.12 
 
 
797 aa  298  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  27.35 
 
 
780 aa  297  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  28.61 
 
 
759 aa  292  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  28.93 
 
 
826 aa  290  9e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  28.81 
 
 
826 aa  289  2e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  28.59 
 
 
760 aa  284  7.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  29.33 
 
 
818 aa  281  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.37 
 
 
741 aa  281  5e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  29.21 
 
 
818 aa  279  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  31 
 
 
888 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.54 
 
 
886 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  30.54 
 
 
886 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  30.54 
 
 
886 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  29.89 
 
 
716 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  29.25 
 
 
755 aa  267  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  29.2 
 
 
808 aa  264  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  29.26 
 
 
806 aa  259  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  27.02 
 
 
751 aa  257  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000708  putative alpha-1,2-mannosidase  26.72 
 
 
901 aa  255  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.5 
 
 
781 aa  249  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  29.19 
 
 
771 aa  247  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  26.87 
 
 
1426 aa  244  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  24.91 
 
 
757 aa  242  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  27.57 
 
 
943 aa  239  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  29.35 
 
 
764 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  27.2 
 
 
1427 aa  234  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  26.4 
 
 
1322 aa  233  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  26.14 
 
 
768 aa  233  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  25.27 
 
 
802 aa  230  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  25.72 
 
 
798 aa  229  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  26.43 
 
 
1124 aa  227  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  26.52 
 
 
1114 aa  227  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  26.73 
 
 
901 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>