134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4648 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
448 aa  914  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  54.99 
 
 
451 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  51.7 
 
 
448 aa  477  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  50.8 
 
 
447 aa  466  1e-130  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  50.11 
 
 
448 aa  452  1e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  50.77 
 
 
457 aa  447  1e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  49.24 
 
 
464 aa  439  1e-122  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  48.91 
 
 
462 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  46.1 
 
 
498 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  46.06 
 
 
457 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  41.83 
 
 
464 aa  380  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  45.16 
 
 
482 aa  340  3e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  38.24 
 
 
450 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  38.77 
 
 
485 aa  273  6e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 
451 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  36.75 
 
 
452 aa  254  2e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  36.54 
 
 
452 aa  254  2e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  4.65499e-06 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  36.17 
 
 
453 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  35.54 
 
 
453 aa  253  4e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 
544 aa  245  1e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  36.45 
 
 
449 aa  245  1e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  34.47 
 
 
452 aa  243  4e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 
449 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 
450 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  35.64 
 
 
450 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  32.82 
 
 
452 aa  234  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  34.18 
 
 
424 aa  219  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  33.84 
 
 
432 aa  212  9e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.99418e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  30.25 
 
 
440 aa  193  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  4.72149e-06 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.89 
 
 
448 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 
436 aa  148  2e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 
455 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  28.73 
 
 
442 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  29.53 
 
 
444 aa  143  7e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 
466 aa  132  2e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 
447 aa  123  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 
447 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 
404 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 
431 aa  68.2  3e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  24.74 
 
 
440 aa  68.2  3e-10  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 
422 aa  67  7e-10  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 
434 aa  64.7  3e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 
442 aa  64.3  4e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 
454 aa  64.3  5e-09  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
408 aa  62.8  1e-08  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  8.92518e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 
417 aa  62.4  2e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 
451 aa  61.2  3e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 
428 aa  61.2  4e-08  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 
419 aa  61.2  4e-08  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.76 
 
 
435 aa  58.5  2e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 
427 aa  58.2  3e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2997  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 
462 aa  57.8  4e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  3.66828e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 
441 aa  57.4  6e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
408 aa  56.2  1e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
435 aa  55.8  1e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 
433 aa  56.2  1e-06  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0199  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 
423 aa  54.7  3e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.136897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0205  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 
423 aa  54.7  3e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 
427 aa  54.7  3e-06  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 
424 aa  54.7  4e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.07 
 
 
406 aa  53.9  5e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  23.8 
 
 
461 aa  53.1  9e-06  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  22.55 
 
 
434 aa  52.8  1e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 
414 aa  52.8  1e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17020  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.78 
 
 
431 aa  51.6  2e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00301962  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 
435 aa  52.4  2e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 
428 aa  52  2e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 
495 aa  52  2e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 
408 aa  52.4  2e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.3 
 
 
427 aa  52.4  2e-05  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
415 aa  51.2  3e-05  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 
421 aa  51.2  4e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 
411 aa  50.8  4e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  22.55 
 
 
410 aa  50.8  5e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 
427 aa  50.8  5e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  21.43 
 
 
441 aa  50.4  6e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 
424 aa  50.4  6e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  20.96 
 
 
435 aa  50.4  7e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  19.42 
 
 
438 aa  50.1  8e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  21.34 
 
 
423 aa  50.1  9e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 
435 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  23.86 
 
 
461 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 
414 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 
422 aa  48.5  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.19 
 
 
438 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 
429 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0654  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 
554 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 
420 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 
420 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 
419 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  21.37 
 
 
424 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
419 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  21.29 
 
 
441 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 
439 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 
458 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 
419 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  8.66815e-05 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  46.81 
 
 
443 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>