More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4572 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 200 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  71.64 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.5 
 
 		 204 aa  257  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  68 
 
 		 203 aa  247  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  62.69 
 
 		 201 aa  227  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  63.18 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.19 
 
 		 201 aa  222  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  62 
 
 		 205 aa  217  8.999999999999998e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.21 
 
 		 201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.21 
 
 		 223 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.61 
 
 		 211 aa  210  9e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.5 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.21 
 
 		 208 aa  208  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  57.5 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  55.72 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  54.73 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  53 
 
 		 205 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  55.22 
 
 		 201 aa  198  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  52.74 
 
 		 227 aa  185  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  50.75 
 
 		 197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  48.51 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.24 
 
 		 201 aa  181  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.5 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  49.75 
 
 		 201 aa  177  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.75 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 200 aa  176  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.53 
 
 		 190 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  48.51 
 
 		 202 aa  174  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.74 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.26 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.26 
 
 		 201 aa  171  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  47.26 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  40.49 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.27 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  40.98 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 200 aa  168  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.03 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 198 aa  166  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  39.51 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.5 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.5 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.27 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  45 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 200 aa  157  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  44.12 
 
 		 202 aa  155  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.26 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.27 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7316  response regulator receiver protein  43.78 
 
 		 201 aa  148  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  41.63 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1383  two component LuxR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000320378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1410  response regulator receiver  34.83 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000440417  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.61 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  38.19 
 
 		 205 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  37.14 
 
 		 218 aa  142  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.27 
 
 		 211 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  46.27 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.5 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.78 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 225 aa  137  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  32.84 
 
 		 200 aa  137  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.41 
 
 		 222 aa  137  8.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.32 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.56 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  36.5 
 
 		 200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  39.9 
 
 		 215 aa  134  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  40 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2689  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.87 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal  0.346923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.16 
 
 		 221 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.62 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.00104431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.47 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.36 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>