More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4481 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  100 
 
 
854 aa  1704    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  43.83 
 
 
849 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  43.97 
 
 
849 aa  594  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  35.85 
 
 
845 aa  421  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  33.52 
 
 
848 aa  403  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  35.14 
 
 
834 aa  406  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  34.66 
 
 
842 aa  399  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  34.7 
 
 
843 aa  397  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  32.27 
 
 
853 aa  365  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  32.84 
 
 
847 aa  361  4e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  31.16 
 
 
859 aa  326  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  31.8 
 
 
852 aa  324  5e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  32.16 
 
 
856 aa  323  6e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  31.44 
 
 
836 aa  316  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  31.93 
 
 
855 aa  306  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  31.28 
 
 
841 aa  303  8.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 
838 aa  296  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  30.06 
 
 
861 aa  290  9e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  29.91 
 
 
873 aa  285  4.0000000000000003e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  29.99 
 
 
825 aa  266  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  31.89 
 
 
806 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  28.24 
 
 
861 aa  258  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  27.66 
 
 
855 aa  254  7e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 
853 aa  246  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  30.48 
 
 
853 aa  244  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  30.04 
 
 
866 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  28.94 
 
 
821 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  29.59 
 
 
839 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31 
 
 
930 aa  213  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  28.33 
 
 
846 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 
871 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  25.95 
 
 
897 aa  190  9e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.72 
 
 
859 aa  190  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.88 
 
 
880 aa  188  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 
878 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  28.6 
 
 
846 aa  186  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 
857 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.67 
 
 
835 aa  179  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.53 
 
 
857 aa  178  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  28.46 
 
 
828 aa  174  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.82 
 
 
858 aa  171  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  27.85 
 
 
855 aa  170  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  33.01 
 
 
857 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  24.24 
 
 
855 aa  136  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  23.26 
 
 
850 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  21.1 
 
 
856 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  23.31 
 
 
851 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  23.85 
 
 
849 aa  126  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  24.12 
 
 
854 aa  124  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  25.27 
 
 
852 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  23.4 
 
 
850 aa  117  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  23.08 
 
 
870 aa  117  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  37.5 
 
 
873 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  27.17 
 
 
843 aa  110  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  25.54 
 
 
822 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  24.49 
 
 
807 aa  104  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  29.19 
 
 
801 aa  103  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  25.22 
 
 
847 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  25.79 
 
 
395 aa  102  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  25.19 
 
 
837 aa  102  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.51 
 
 
863 aa  101  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  27.16 
 
 
841 aa  100  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 
847 aa  100  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  23.95 
 
 
866 aa  99.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  22.27 
 
 
794 aa  98.6  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  21.48 
 
 
850 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  22.74 
 
 
855 aa  97.4  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  24.31 
 
 
822 aa  95.9  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.87 
 
 
443 aa  92.8  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  24.96 
 
 
839 aa  91.3  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  20.52 
 
 
833 aa  90.9  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 
413 aa  90.9  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  26.11 
 
 
402 aa  90.1  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.68 
 
 
664 aa  90.1  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  24.8 
 
 
845 aa  90.1  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 
849 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  19.8 
 
 
829 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  19.68 
 
 
829 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4065  protein of unknown function DUF214  31.9 
 
 
488 aa  84  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.422089 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  24.29 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  24.73 
 
 
828 aa  82.4  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  35.76 
 
 
427 aa  82  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  24.29 
 
 
404 aa  82  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  23.04 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 
452 aa  81.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4806  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 
867 aa  81.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  24.11 
 
 
858 aa  81.3  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.76 
 
 
386 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  28.55 
 
 
826 aa  79.7  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4607  protein of unknown function DUF214  26.78 
 
 
852 aa  79  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.764847  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  27.69 
 
 
381 aa  79  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  33.58 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 
849 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  22.39 
 
 
858 aa  77.8  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  30.86 
 
 
828 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1413  hypothetical protein  25.99 
 
 
926 aa  77  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.232958  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  29.65 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  24.11 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2606  hypothetical protein  26.11 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000189226  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2537  hypothetical protein  27.69 
 
 
793 aa  75.1  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.22202  hitchhiker  0.0000000191831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>