17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4337 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4337  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
467 aa  882    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.848545  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2119  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6615  major facilitator superfamily MFS_1  37.64 
 
 
447 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251672  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0385  hypothetical protein  32.79 
 
 
376 aa  63.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3065  major facilitator transporter  38.06 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000480105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0097  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 
529 aa  60.1  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  25.54 
 
 
445 aa  49.3  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  30.64 
 
 
432 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6165  hypothetical protein  38.12 
 
 
414 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853995  hitchhiker  0.00553509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  27.27 
 
 
412 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
419 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  28.73 
 
 
445 aa  44.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  28.49 
 
 
412 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  28.07 
 
 
457 aa  44.3  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
432 aa  44.3  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.49 
 
 
1833 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  27.13 
 
 
414 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>