More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4327 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
154 aa  311  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4349  transcriptional regulator, AsnC family  66.44 
 
 
152 aa  197  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0499883  normal  0.877565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2159  transcriptional regulator, AsnC family  56.29 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.106753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 
153 aa  140  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2542  transcriptional regulator, AsnC family  46.9 
 
 
155 aa  140  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.44011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 
171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4335  transcriptional regulator, AsnC family  42.48 
 
 
173 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 
203 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8185  putative transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 
165 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  43.57 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2562  transcriptional regulator, AsnC family  39.31 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12792  Lrp/Asn family transcriptional regulator  40.14 
 
 
179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  42.55 
 
 
159 aa  111  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  41.55 
 
 
159 aa  110  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6556  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.604564  normal  0.177628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 
180 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2850  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
167 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 
180 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 
180 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19900  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 
157 aa  107  5e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.578374  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
171 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 
157 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3819  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 
155 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  42.45 
 
 
157 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4086  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.57 
 
 
169 aa  104  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.934568 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
159 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
181 aa  100  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 
168 aa  100  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
166 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 
169 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3337  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 
166 aa  99  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1662  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 
156 aa  97.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.070464  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0512  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
165 aa  97.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 
158 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1502  leucine-responsive regulatory protein  34 
 
 
156 aa  96.7  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1452  leucine-responsive regulatory protein  34 
 
 
156 aa  96.7  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.423592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  34.44 
 
 
158 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
175 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0615  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
166 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.615736  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  30.56 
 
 
175 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  36.23 
 
 
166 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  29.86 
 
 
176 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1577  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 
163 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0229  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
166 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  30.72 
 
 
158 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  32 
 
 
162 aa  91.7  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
157 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 
152 aa  90.9  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
156 aa  90.9  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
157 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 
157 aa  90.5  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1877  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
164 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  32.64 
 
 
161 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 
165 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3138  transcriptional regulator AsnC family  30.99 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  30.82 
 
 
162 aa  87.8  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2981  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 
175 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
157 aa  87.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
172 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  30.43 
 
 
156 aa  87  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
156 aa  87  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  27.89 
 
 
161 aa  86.3  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2720  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.380031  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5907  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 
161 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0023  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.28543  normal  0.347248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2495  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775617  normal  0.732108 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2600  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1965  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2624  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30758  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2576  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  27.59 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
165 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  32.87 
 
 
166 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 
167 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  32.87 
 
 
172 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0721  AsnC family transcriptional regulator  31.94 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  28.87 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>