More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4324 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 516 aa  1000    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  56.84 
 
 		 516 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  48.54 
 
 		 511 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  46.85 
 
 		 510 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  42.19 
 
 		 517 aa  306  7e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 525 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  38.98 
 
 		 525 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 525 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 		 528 aa  295  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 		 555 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 		 521 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 		 518 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 		 562 aa  280  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 533 aa  280  6e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  37.52 
 
 		 524 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 516 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 		 509 aa  277  4e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 524 aa  276  8e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 526 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  42.31 
 
 		 517 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 500 aa  273  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 516 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  45.58 
 
 		 528 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 509 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 514 aa  268  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 		 513 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  39.68 
 
 		 535 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 500 aa  264  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 584 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 503 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 517 aa  261  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 		 588 aa  260  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  38.2 
 
 		 554 aa  259  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  38.76 
 
 		 513 aa  259  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  35.39 
 
 		 508 aa  259  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  38.87 
 
 		 481 aa  256  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 		 503 aa  256  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  40.85 
 
 		 513 aa  256  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 509 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 532 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 		 521 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 528 aa  254  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  36.53 
 
 		 508 aa  252  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  34.73 
 
 		 500 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 		 496 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 		 529 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  37.27 
 
 		 505 aa  248  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 		 553 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 		 519 aa  248  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 495 aa  246  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 		 490 aa  246  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 558 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  40.3 
 
 		 502 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 507 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.48 
 
 		 519 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.24 
 
 		 537 aa  243  7e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  34.18 
 
 		 541 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  37.88 
 
 		 601 aa  239  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  40.08 
 
 		 511 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 540 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 513 aa  238  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 		 501 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 514 aa  237  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 536 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 503 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 575 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 523 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 494 aa  230  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 539 aa  229  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  35.02 
 
 		 501 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 497 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 		 536 aa  229  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 535 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  33.13 
 
 		 495 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 509 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  33.33 
 
 		 495 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  33.33 
 
 		 495 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  33.33 
 
 		 495 aa  223  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  32.93 
 
 		 492 aa  223  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  33.33 
 
 		 495 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.37 
 
 		 478 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.37 
 
 		 484 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.53 
 
 		 520 aa  219  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 520 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  35.21 
 
 		 502 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 528 aa  217  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 		 514 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  35.5 
 
 		 501 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.53 
 
 		 538 aa  216  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 506 aa  216  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.63 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.6 
 
 		 534 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.55 
 
 		 607 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 486 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 486 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 486 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 486 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 486 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.99 
 
 		 486 aa  211  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>