More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4299 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
144 aa  285  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  75.36 
 
 
150 aa  205  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  60.42 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  61.7 
 
 
144 aa  169  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  65.38 
 
 
150 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  65.38 
 
 
150 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  65.38 
 
 
150 aa  167  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  65.29 
 
 
140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  50 
 
 
141 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  44.78 
 
 
144 aa  107  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.54 
 
 
156 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  46.55 
 
 
147 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  46.55 
 
 
153 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  44.35 
 
 
148 aa  104  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  46.03 
 
 
160 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  44.63 
 
 
139 aa  103  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  43.09 
 
 
146 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  47.2 
 
 
154 aa  103  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  43.09 
 
 
146 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  43.09 
 
 
146 aa  103  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  44.83 
 
 
148 aa  103  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  47.11 
 
 
145 aa  103  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  45.76 
 
 
149 aa  102  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  48.39 
 
 
145 aa  102  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  43.55 
 
 
150 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  44.72 
 
 
147 aa  100  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
147 aa  100  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  42.98 
 
 
143 aa  100  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  47.27 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
156 aa  99.4  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  42.19 
 
 
164 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  49.17 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  43.65 
 
 
157 aa  97.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  41.53 
 
 
151 aa  97.1  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  43.08 
 
 
168 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  43.65 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  45.22 
 
 
168 aa  95.5  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  40.91 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  42.24 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 
168 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  42.19 
 
 
182 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  41.27 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
168 aa  88.6  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 
147 aa  87  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  39.64 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
142 aa  84  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 
319 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 
303 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  42.28 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 
316 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  46.99 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  46.99 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 
304 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  38.98 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  42.86 
 
 
134 aa  77  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
306 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  39.52 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 
305 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 
307 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 
261 aa  72  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  32.61 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  47.06 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5508  helix-turn-helix domain-containing protein  35.54 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2898  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 
282 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  36.46 
 
 
293 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 
301 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 
301 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  37.37 
 
 
301 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  38 
 
 
315 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  46.88 
 
 
250 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
300 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  37.07 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 
316 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  37.89 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
309 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 
292 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
311 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
311 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 
289 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 
282 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
311 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
274 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 
284 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  46.25 
 
 
305 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 
291 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  42 
 
 
263 aa  67.4  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 
278 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
316 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 
290 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 
300 aa  67  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  42.42 
 
 
329 aa  67  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>