46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4253 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4253  6-kinase  100 
 
 
309 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5378  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.87 
 
 
307 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2219  6-kinase  33.65 
 
 
307 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000195606  decreased coverage  0.000000830578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0803  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.21 
 
 
285 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3440  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.03 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.0646314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1892  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.06 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.565098  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0261  6-kinase  32.47 
 
 
312 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2714  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.91 
 
 
298 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2285  aminoglycoside phosphotransferase  29.53 
 
 
329 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1604  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.18 
 
 
310 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0859815  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0514  aminoglycoside phosphotransferase family protein  28.07 
 
 
323 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1410  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.79 
 
 
331 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.189739  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1665  hydroxyurea phosphotransferase  27.72 
 
 
468 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30370  streptomycin 6-kinase  29.02 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4430  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.49 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796967  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4087  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.79 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1422  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.62 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000015998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3746  kinase  29.12 
 
 
295 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2188  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.2 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3035  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.13 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3432  streptomycin 3''-kinase  30.15 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4780  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.13 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.35446  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40450  streptomycin 3''-phosphotransferase  28.68 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24730  streptomycin 6-kinase  29.96 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320785  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5323  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.41 
 
 
286 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2227  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.47 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000351208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2429  streptomycin 6-kinase  27.39 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5400  methionyl aminopeptidase  31.58 
 
 
592 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0213  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.57 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53187  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4830  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.46 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5439  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.46 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5423  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.46 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3331  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.69 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0145653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0298  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.65 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.449073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2726  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.67 
 
 
266 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167772  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1244  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.76 
 
 
272 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761762  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2660  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.46 
 
 
302 aa  52.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.31665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7130  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.73 
 
 
267 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2795  3''-kinase  28.12 
 
 
265 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.342668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3719  streptomycin 3''-kinase  26.79 
 
 
266 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2457  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.65 
 
 
271 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35670  streptomycin 6-kinase  28.21 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1923  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.8 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.970789  normal  0.364097 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3891  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.27 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.571465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2987  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  26.79 
 
 
266 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0510787 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6740  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.07 
 
 
195 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.515354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>