More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4132 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  43.97 
 
 
3930 aa  1369    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.43 
 
 
7110 aa  1484    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.02 
 
 
5400 aa  1250    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  45.69 
 
 
3463 aa  1295    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  51.12 
 
 
1305 aa  833    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  48.92 
 
 
1548 aa  759    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  49.62 
 
 
3158 aa  1070    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  43.02 
 
 
2846 aa  1480    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  54.03 
 
 
1584 aa  901    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  46.41 
 
 
4607 aa  969    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  39.33 
 
 
3281 aa  931    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  45.71 
 
 
1602 aa  925    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  51.13 
 
 
3254 aa  848    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  45.98 
 
 
1831 aa  1304    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  45.63 
 
 
2376 aa  744    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  39 
 
 
2719 aa  1130    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  38.78 
 
 
2066 aa  959    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  33.06 
 
 
2333 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  49.28 
 
 
3033 aa  835    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  49.44 
 
 
4151 aa  1066    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  45.06 
 
 
3711 aa  1229    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  41.22 
 
 
4882 aa  1142    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  47.42 
 
 
3493 aa  1032    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.39 
 
 
2136 aa  656    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
1874 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.48 
 
 
1867 aa  1308    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  40.27 
 
 
1144 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  46 
 
 
1573 aa  697    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  47.18 
 
 
1071 aa  693    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  48.4 
 
 
7279 aa  1433    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.81 
 
 
1837 aa  941    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  44.29 
 
 
2060 aa  831    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  45.65 
 
 
1820 aa  1238    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  44.72 
 
 
4930 aa  1227    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  50.46 
 
 
2966 aa  1055    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  55.6 
 
 
2108 aa  1350    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  47.96 
 
 
5255 aa  1380    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  43.24 
 
 
2081 aa  725    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  100 
 
 
2277 aa  4511    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  38.35 
 
 
3176 aa  646    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  45.19 
 
 
1924 aa  943    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  45.92 
 
 
2367 aa  972    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  54.3 
 
 
1601 aa  862    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  37.61 
 
 
4264 aa  1074    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  36.3 
 
 
3693 aa  713    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  41.73 
 
 
3449 aa  1199    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  46.49 
 
 
4080 aa  1565    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  38.14 
 
 
2890 aa  674    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  37.81 
 
 
2085 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  49.57 
 
 
3408 aa  1295    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  33.35 
 
 
1704 aa  638    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  45.01 
 
 
4111 aa  1013    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  43.36 
 
 
4575 aa  1046    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  48.02 
 
 
3148 aa  744    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  44.42 
 
 
2020 aa  942    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  46.95 
 
 
1789 aa  1338    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.71 
 
 
2078 aa  929    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.85 
 
 
1822 aa  704    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  43.96 
 
 
2024 aa  684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.34 
 
 
3092 aa  789    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  47.05 
 
 
1126 aa  697    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  49.09 
 
 
6768 aa  1110    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  46.33 
 
 
2374 aa  754    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  53.42 
 
 
1593 aa  806    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  36.3 
 
 
3693 aa  713    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  46.14 
 
 
3494 aa  1343    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  51.08 
 
 
1101 aa  807    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  43.44 
 
 
2847 aa  1384    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0494  Acyl transferase  46.85 
 
 
2666 aa  769    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  37.81 
 
 
2085 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  32.8 
 
 
1876 aa  639    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  33.35 
 
 
1704 aa  638    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.01 
 
 
3676 aa  707    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  49.35 
 
 
1114 aa  830    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  39.27 
 
 
3696 aa  711    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  47.17 
 
 
5154 aa  1249    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  45.85 
 
 
2090 aa  1191    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  46.89 
 
 
1077 aa  711    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  43.28 
 
 
2107 aa  1027    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  48.73 
 
 
7210 aa  1477    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  45.29 
 
 
3508 aa  1355    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  51.07 
 
 
1143 aa  803    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.26 
 
 
1939 aa  680    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  37.21 
 
 
2230 aa  694    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  37.71 
 
 
2232 aa  715    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  46.08 
 
 
1955 aa  724    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  39.66 
 
 
4183 aa  735    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  48.76 
 
 
3355 aa  1245    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.15 
 
 
3702 aa  711    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.86 
 
 
3874 aa  1316    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  47.74 
 
 
3670 aa  1012    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  37.81 
 
 
2085 aa  643    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.28 
 
 
1816 aa  1241    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  41.67 
 
 
4840 aa  1157    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  48.46 
 
 
2126 aa  1065    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  42.28 
 
 
2113 aa  1026    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  37.01 
 
 
3679 aa  701    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.21 
 
 
1832 aa  635  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  36.14 
 
 
2220 aa  630  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  33.07 
 
 
1704 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>