59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4121 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  57.72 
 
 		 131 aa  157  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  57.72 
 
 		 131 aa  155  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  42.06 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  42.62 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  46.34 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  43.55 
 
 		 138 aa  113  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  39.34 
 
 		 143 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  43.51 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  44.72 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 138 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 135 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 132 aa  103  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 168 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  37.6 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  40.94 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  46.79 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  38.33 
 
 		 135 aa  94.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  40.91 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 139 aa  93.6  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 140 aa  90.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 232 aa  50.4  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  32.95 
 
 		 231 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 207 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  31.82 
 
 		 231 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  31.82 
 
 		 231 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  32.95 
 
 		 231 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  31.82 
 
 		 231 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  31.82 
 
 		 231 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  31.82 
 
 		 231 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  31.82 
 
 		 231 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  30.68 
 
 		 231 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  30.68 
 
 		 231 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.13 
 
 		 216 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  33.33 
 
 		 248 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  28.09 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  28.09 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  28.09 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  28.09 
 
 		 233 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  28.09 
 
 		 233 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.17 
 
 		 224 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  28.09 
 
 		 233 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  28.09 
 
 		 233 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  31.18 
 
 		 223 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  31.18 
 
 		 223 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  32.18 
 
 		 248 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  31.87 
 
 		 248 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  31.46 
 
 		 235 aa  40  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>