More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4107 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 393 aa  763    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  54.43 
 
 		 393 aa  363  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  58.12 
 
 		 389 aa  349  6e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  52.66 
 
 		 398 aa  322  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  52.2 
 
 		 379 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  45.68 
 
 		 389 aa  285  9e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  30.43 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 391 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  30.43 
 
 		 391 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  30.43 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  30.43 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  30.18 
 
 		 391 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  29.92 
 
 		 391 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  29.92 
 
 		 391 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  30.73 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 401 aa  170  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  30.09 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  33.16 
 
 		 371 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  33.68 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 375 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 375 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  30.69 
 
 		 378 aa  143  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  26.22 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  26.22 
 
 		 369 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  26.6 
 
 		 369 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  26.33 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.95 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  26.33 
 
 		 369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  26.33 
 
 		 369 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  26.33 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  26.33 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  25.88 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  26.91 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  31.07 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.22 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  31.75 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  29.49 
 
 		 368 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  30.42 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  31.95 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.61 
 
 		 378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 441 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 378 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  27.08 
 
 		 460 aa  119  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.3 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 378 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1383  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000059917  normal  0.119954 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  31.93 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  29.43 
 
 		 372 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 385 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 385 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 375 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  28.54 
 
 		 416 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  28.29 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  28.77 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  32.79 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 419 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.06 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  29.89 
 
 		 363 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 427 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  29.97 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  29.07 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 379 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  28.13 
 
 		 383 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  31.69 
 
 		 402 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 378 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.2 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1418  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.66 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0869563  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2196  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.66 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270908  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  32.28 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 		 960 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.37 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0474  FAD-dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1888  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.66 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0571  FAD-dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  32.02 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  30 
 
 		 374 aa  106  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 378 aa  106  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  32 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>