More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4064 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
548 aa  1093    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  37.55 
 
 
509 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  35.71 
 
 
506 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  34.83 
 
 
511 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  36.29 
 
 
506 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  37.07 
 
 
512 aa  303  5.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  32.54 
 
 
506 aa  295  2e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  32.93 
 
 
503 aa  293  5e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  36.4 
 
 
510 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  33.93 
 
 
518 aa  283  8.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  38.42 
 
 
514 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  37.96 
 
 
514 aa  279  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.73 
 
 
500 aa  277  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  32.32 
 
 
501 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  34.98 
 
 
512 aa  272  9e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  35.55 
 
 
515 aa  272  1e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  34.46 
 
 
512 aa  272  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  37.02 
 
 
511 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  31.16 
 
 
509 aa  270  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  35.8 
 
 
538 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  37.82 
 
 
498 aa  270  7e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  33.8 
 
 
496 aa  270  7e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  30.85 
 
 
497 aa  269  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  31.94 
 
 
502 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  38.05 
 
 
508 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  35.44 
 
 
504 aa  265  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  32.14 
 
 
499 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  37.7 
 
 
515 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  37.7 
 
 
515 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  37.7 
 
 
515 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  31.57 
 
 
509 aa  259  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  35.54 
 
 
506 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  37.4 
 
 
515 aa  258  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  35.35 
 
 
505 aa  256  7e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  37.94 
 
 
515 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  37.8 
 
 
515 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  30.3 
 
 
496 aa  254  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  32.8 
 
 
511 aa  254  4.0000000000000004e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.84 
 
 
492 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.84 
 
 
492 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  39.41 
 
 
520 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  34.58 
 
 
512 aa  250  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  35.4 
 
 
499 aa  249  8e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  29.12 
 
 
500 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  37.99 
 
 
514 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  37.65 
 
 
498 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  28.71 
 
 
489 aa  243  9e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  37.94 
 
 
513 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  37.94 
 
 
513 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  37.94 
 
 
513 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  37.94 
 
 
513 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  37.94 
 
 
513 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  37.94 
 
 
513 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  38.24 
 
 
513 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  35.62 
 
 
505 aa  241  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  36.62 
 
 
505 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  33.2 
 
 
495 aa  239  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  36.35 
 
 
495 aa  237  3e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.25 
 
 
498 aa  236  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  30.3 
 
 
488 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  29.23 
 
 
505 aa  230  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  34.77 
 
 
501 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  30.98 
 
 
519 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  34.33 
 
 
506 aa  223  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  28.03 
 
 
490 aa  223  9e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  35.35 
 
 
506 aa  223  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  32.43 
 
 
524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  33.67 
 
 
511 aa  219  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  32.14 
 
 
493 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  33.07 
 
 
517 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  33.07 
 
 
517 aa  217  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  27.44 
 
 
503 aa  217  4e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  33.73 
 
 
489 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  30.88 
 
 
497 aa  216  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  35.21 
 
 
501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  32.87 
 
 
499 aa  213  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  34.21 
 
 
481 aa  213  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  31.87 
 
 
505 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3313  carbohydrate kinase, FGGY  33.27 
 
 
503 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  26.85 
 
 
506 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  30.82 
 
 
499 aa  206  7e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2134  putative carbohydrate kinase  29.51 
 
 
520 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  29.56 
 
 
502 aa  203  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  29.47 
 
 
519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24960  putative carbohydrate kinase  29.5 
 
 
519 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  28.96 
 
 
514 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  34.46 
 
 
493 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  34.46 
 
 
493 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  34.46 
 
 
493 aa  200  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5229  xylulose kinase  28.96 
 
 
532 aa  200  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  34.19 
 
 
524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  27.36 
 
 
512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  29.37 
 
 
519 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  27.33 
 
 
499 aa  197  6e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5747  glycerol kinase  33.55 
 
 
488 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259749  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4357  carbohydrate kinase FGGY  28.46 
 
 
528 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  29.98 
 
 
496 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2334  carbohydrate kinase, FGGY  29.98 
 
 
519 aa  195  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  31.5 
 
 
496 aa  195  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3101  glycerol kinase  32.51 
 
 
493 aa  195  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.521145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>