More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4047 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
256 aa  520  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1362  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  51.17 
 
 
259 aa  250  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0148022  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5228  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  49.42 
 
 
272 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2561  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.19 
 
 
259 aa  245  5e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0823  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.25 
 
 
266 aa  243  1e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1407  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  48.25 
 
 
265 aa  243  2e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.458712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1404  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.05 
 
 
259 aa  242  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2283  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  47.1 
 
 
263 aa  238  7e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2332  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.72 
 
 
262 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.69 
 
 
292 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4131  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.86 
 
 
259 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6111  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  47.49 
 
 
262 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4963  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  46.51 
 
 
259 aa  234  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20800  NAD(P)H quinone oxidoreductase  48.65 
 
 
265 aa  234  1e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689455  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1711  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  46.33 
 
 
263 aa  233  2e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1713  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.42 
 
 
268 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4596  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.51 
 
 
259 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3767  hypothetical protein  46.51 
 
 
259 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.241129  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3756  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.21 
 
 
259 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0470076  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4021  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  45.35 
 
 
261 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199607  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2460  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  46.88 
 
 
258 aa  229  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.31 
 
 
266 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333556 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3569  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.72 
 
 
270 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.178217 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3903  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  44.92 
 
 
258 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.96153 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1711  quinone reductase  44.57 
 
 
290 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4017  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  44.92 
 
 
258 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117199  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0903  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  44.57 
 
 
258 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.354298  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2166  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  44.57 
 
 
258 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.7083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  44.57 
 
 
258 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.693608  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0261  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  44.57 
 
 
258 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254456  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1893  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  44.57 
 
 
258 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58124  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5496  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.56 
 
 
261 aa  222  5e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.993327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.79 
 
 
265 aa  221  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1088  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.42 
 
 
261 aa  221  1e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3642  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  45.17 
 
 
261 aa  221  1e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750916  normal  0.729686 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17880  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  50.39 
 
 
264 aa  221  1e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.615091  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0353  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  44.57 
 
 
258 aa  220  2e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.71 
 
 
272 aa  215  6e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.485932 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2859  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.77 
 
 
290 aa  214  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2368  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.06 
 
 
232 aa  214  1e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4164  quinone reductase  44.96 
 
 
259 aa  214  2e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.477196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35820  Oxidoreductase  42.58 
 
 
266 aa  201  1e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19550  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  43.65 
 
 
265 aa  200  2e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.29 
 
 
244 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2187  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  40.27 
 
 
233 aa  174  1e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.415147  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3720  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  40.27 
 
 
235 aa  173  3e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.405823  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2044  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  39.82 
 
 
235 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.747837  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65760  NAD(P)H quinone oxidoreductase  39.08 
 
 
234 aa  165  7e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299621  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  40.64 
 
 
213 aa  165  7e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3318  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.92 
 
 
237 aa  162  5e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5708  NAD(P)H quinone oxidoreductase  39.82 
 
 
238 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  33.48 
 
 
222 aa  145  7e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  38.67 
 
 
200 aa  145  8e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0147  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.45 
 
 
249 aa  139  4e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4986  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  33.93 
 
 
222 aa  135  6e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.354623 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0109  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.1 
 
 
223 aa  126  4e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.12066  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2429  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.47 
 
 
255 aa  114  2e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.391574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.86 
 
 
193 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  37.14 
 
 
193 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.86 
 
 
193 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.14 
 
 
193 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  37.86 
 
 
193 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  37.14 
 
 
193 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.14 
 
 
193 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  37.14 
 
 
193 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  39.84 
 
 
193 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3978  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.85 
 
 
259 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00187399  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  37.14 
 
 
193 aa  102  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.88 
 
 
192 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  4.56035e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
194 aa  99.8  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7957  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
195 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4755  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.21 
 
 
195 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4702  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.14 
 
 
203 aa  89.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.352424  normal  0.510375 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6287  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.1 
 
 
198 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0573  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  26.82 
 
 
206 aa  88.6  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1476  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.84 
 
 
193 aa  86.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3388  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.61 
 
 
193 aa  85.5  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3377  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.17 
 
 
219 aa  84.7  1e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.88 
 
 
196 aa  82.8  5e-15  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3056  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.03 
 
 
194 aa  81.6  1e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2434  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.29 
 
 
247 aa  81.3  1e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1267  putative NAD(P)H dehydrogenase (quinone) protein  30.92 
 
 
194 aa  80.9  2e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.497148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3697  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.26 
 
 
197 aa  80.5  2e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
191 aa  79.7  5e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48440  putative NAD(P)H dehydrogenase  32.43 
 
 
201 aa  79.3  5e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.54354e-09  normal  0.129613 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.89 
 
 
191 aa  79  6e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  32.26 
 
 
198 aa  79  7e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1378  quinone dependent NAD(P)H dehydrogenase  33.33 
 
 
211 aa  79  7e-14  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367665  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  32.03 
 
 
191 aa  79  8e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  32.68 
 
 
191 aa  78.6  9e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3280  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
194 aa  78.6  9e-14  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  32.03 
 
 
191 aa  78.2  1e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0595  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  31.34 
 
 
176 aa  77.8  2e-13  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0052  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  32.55 
 
 
176 aa  77.4  2e-13  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0050  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  32.55 
 
 
176 aa  77.4  2e-13  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0050  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  31.8 
 
 
176 aa  77  2e-13  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.37 
 
 
191 aa  77.4  2e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3256  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
194 aa  77.4  2e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3553  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.55 
 
 
176 aa  77.4  2e-13  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0048  glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefF  32.55 
 
 
176 aa  77.4  2e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.543234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>