16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4024 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4024  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  253  7e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3956  hypothetical protein  47.29 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0019599  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3577  hypothetical protein  44.63 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1815  hypothetical protein  42.74 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000174188  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3537  hypothetical protein  35 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000060722  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3346  hypothetical protein  32.14 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11373  lipoprotein lprD  36.7 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.282281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4326  hypothetical protein  30.08 
 
 		 224 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.922278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2363  putative lipoprotein  34.23 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24660  hypothetical protein  30.28 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.64549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1975  Glucitol operon activator-like protein  34.95 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1300  hypothetical protein  33.87 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.135235  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4283  putative lipoprotein  46.34 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.309945  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5662  Glucitol operon activator-like protein  44.19 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0283  hypothetical protein  41.79 
 
 		 180 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3840  putative lipoprotein  32.69 
 
 		 140 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0692951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>