More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4001 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  48.95 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  49.38 
 
 		 224 aa  147  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  52.29 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  46.03 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  47.59 
 
 		 272 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  46.03 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  46.24 
 
 		 219 aa  137  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  47.16 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  43.75 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  46.15 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  49.34 
 
 		 230 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  45.21 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  51.11 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  51.11 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  41.92 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  39.88 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  40.78 
 
 		 182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  43.64 
 
 		 182 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  44.94 
 
 		 291 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  42.69 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  44.17 
 
 		 165 aa  90.9  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  36.02 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  38.64 
 
 		 210 aa  85.9  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  39.41 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 176 aa  84.7  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  32.7 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  41.81 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 		 162 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  42.21 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  38.19 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  36.47 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  37.29 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  37.74 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  34.12 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  35.88 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  40.88 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  34.13 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  32.09 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 174 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  34.38 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  31.03 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  30.99 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  32.62 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  30.06 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  37.01 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  35.71 
 
 		 164 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  32.8 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  31.9 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  34.42 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  33.15 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  34.81 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  44.77 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  32.97 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  32.45 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  33.81 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  35.81 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  32.12 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  32.32 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  33.51 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  33.51 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  33.51 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  33.33 
 
 		 169 aa  72  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2206  lipoprotein signal peptidase  35.2 
 
 		 173 aa  72  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.759642  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  35.95 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  36.48 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>