76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3999 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  100 
 
 
334 aa  671    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  66.67 
 
 
487 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  67.05 
 
 
474 aa  338  9.999999999999999e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  42.6 
 
 
534 aa  205  8e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  42.65 
 
 
617 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  40.62 
 
 
533 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  39.62 
 
 
586 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  42.02 
 
 
439 aa  193  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  38.64 
 
 
542 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  33.64 
 
 
343 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  34.94 
 
 
497 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  37.37 
 
 
771 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  32.71 
 
 
478 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  33.08 
 
 
388 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  33.08 
 
 
388 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  33.08 
 
 
388 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  36.14 
 
 
639 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  36.95 
 
 
665 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  33.73 
 
 
494 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  33.73 
 
 
485 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  35.08 
 
 
330 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  34.8 
 
 
478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  33.72 
 
 
364 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  33.46 
 
 
899 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  33.96 
 
 
495 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  34.27 
 
 
405 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  30.54 
 
 
362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.86 
 
 
698 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  34.14 
 
 
619 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  32.6 
 
 
418 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  33.45 
 
 
759 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  29.84 
 
 
544 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  31.87 
 
 
346 aa  96.3  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  24.11 
 
 
414 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  24.11 
 
 
552 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  26.42 
 
 
416 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  26.79 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  27.6 
 
 
587 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  27.97 
 
 
455 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.51 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  26.53 
 
 
463 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  27.54 
 
 
425 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  24.69 
 
 
475 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  24.69 
 
 
475 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  24.69 
 
 
475 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  28.85 
 
 
544 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  24.42 
 
 
968 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  29.66 
 
 
341 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  31.18 
 
 
390 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  23.79 
 
 
811 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  30.6 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  25.65 
 
 
397 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  26.29 
 
 
666 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  27.17 
 
 
319 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  27.17 
 
 
319 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  25.73 
 
 
402 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  25.6 
 
 
390 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  27.17 
 
 
319 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  27.88 
 
 
380 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  26.78 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  24.91 
 
 
1132 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  23.3 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.2 
 
 
532 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  24.81 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  22.18 
 
 
926 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.28 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.28 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  24.29 
 
 
1160 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  25.57 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1469  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.28 
 
 
281 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  29.11 
 
 
279 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  22.71 
 
 
402 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  22.71 
 
 
402 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  22.71 
 
 
402 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.46 
 
 
304 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.57 
 
 
294 aa  42.7  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>