More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3892 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
396 aa  801    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  53.71 
 
 
388 aa  408  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  53.45 
 
 
388 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  56.58 
 
 
393 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  45.32 
 
 
395 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  39.72 
 
 
387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  36.32 
 
 
496 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  35.66 
 
 
418 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  33.6 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  35.28 
 
 
391 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 
413 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  32.37 
 
 
390 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  36.26 
 
 
381 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 
402 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  33.5 
 
 
399 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  33.89 
 
 
407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  35.49 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  34.08 
 
 
389 aa  183  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  32.16 
 
 
402 aa  179  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  35.11 
 
 
400 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  35.66 
 
 
400 aa  176  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 
377 aa  176  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  34.65 
 
 
404 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  31.09 
 
 
388 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  36 
 
 
374 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  34.15 
 
 
396 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.31 
 
 
403 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  33.51 
 
 
388 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  34.28 
 
 
393 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  30.91 
 
 
467 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  34.01 
 
 
371 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  32.35 
 
 
424 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  33.33 
 
 
386 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  32.48 
 
 
371 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  32.21 
 
 
397 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  33.51 
 
 
434 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  31.38 
 
 
400 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  30.93 
 
 
400 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  32.44 
 
 
424 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  30.93 
 
 
400 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  32.46 
 
 
372 aa  146  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  30.73 
 
 
402 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.32 
 
 
398 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  29.89 
 
 
370 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  32.6 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  30.99 
 
 
403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  29.41 
 
 
405 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  30.52 
 
 
372 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  31.47 
 
 
387 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  29.97 
 
 
415 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  31.17 
 
 
380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  32.08 
 
 
392 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  29.2 
 
 
423 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  28.61 
 
 
415 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  29.6 
 
 
408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  29.09 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  28.35 
 
 
398 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  29.7 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  29.32 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  30.11 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  30.24 
 
 
376 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  26.98 
 
 
368 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  25.87 
 
 
400 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  26.69 
 
 
368 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  30.99 
 
 
393 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  28.07 
 
 
364 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  28.28 
 
 
364 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  27.86 
 
 
360 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  29.97 
 
 
379 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  25.15 
 
 
391 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  30.21 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  27.56 
 
 
397 aa  96.7  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  30.25 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  28.76 
 
 
421 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4013  monooxygenase FAD-binding  28.57 
 
 
362 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0834664  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  28.23 
 
 
369 aa  92.8  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  29.03 
 
 
376 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  27.68 
 
 
369 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  27.22 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3968  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 
362 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  28.78 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  29.58 
 
 
399 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  28.66 
 
 
378 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  28.07 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7773  monooxygenase FAD-binding  28.12 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  28.28 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  27.57 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  26.74 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  27.57 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  26.71 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  27.55 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.57 
 
 
377 aa  84  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  27.89 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  27.76 
 
 
371 aa  83.2  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  28.65 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  27.73 
 
 
395 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  27.98 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  26.33 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  27.39 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  30.66 
 
 
367 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>