More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3867 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3867  periplasmic binding protein  100 
 
 
316 aa  628  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129858  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0297  periplasmic binding protein  47.74 
 
 
323 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3006  periplasmic binding protein  45.78 
 
 
323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000872472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30480  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  42.86 
 
 
332 aa  232  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.178307  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2294  periplasmic binding protein  43.31 
 
 
330 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3055  periplasmic binding protein  41.44 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2464  periplasmic binding protein  35.12 
 
 
351 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1909  periplasmic binding protein  34.44 
 
 
335 aa  174  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.12 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.44 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  33.12 
 
 
324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  31.56 
 
 
324 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  31.56 
 
 
324 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  31.56 
 
 
324 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4356  periplasmic binding protein  32.49 
 
 
324 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200584  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1739  periplasmic binding protein  33.11 
 
 
352 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  31.75 
 
 
300 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  33.09 
 
 
312 aa  136  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  27.72 
 
 
309 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1050  periplasmic binding protein  33.96 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.637791  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1738  periplasmic binding protein  28.38 
 
 
363 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.028401  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2189  periplasmic binding protein  27.07 
 
 
309 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3977  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  26.67 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0151  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.17 
 
 
296 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3332  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.16 
 
 
303 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0997  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.16 
 
 
303 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3108  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.06 
 
 
308 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3461  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.16 
 
 
350 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2782  periplasmic binding protein  28.91 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2813  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  25.28 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6475  periplasmic binding protein  25.58 
 
 
292 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50340  iron(III)-siderophore-binding periplasmic protein  27.27 
 
 
292 aa  93.2  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.318256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1170  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.71 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0157  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.06 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0144  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.06 
 
 
296 aa  89.7  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3450  periplasmic binding protein  24.06 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202781  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0156  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.06 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3507  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.06 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000933155  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  28.4 
 
 
327 aa  89.4  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  28.4 
 
 
327 aa  89.4  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00151  iron-hydroxamate transporter subunit  24.06 
 
 
296 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000912024  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0164  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.33 
 
 
296 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00150  hypothetical protein  24.06 
 
 
296 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000817605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0162  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  23.68 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.16 
 
 
322 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0692  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  23.37 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40073  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2582  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  22.89 
 
 
319 aa  86.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00742029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.85 
 
 
322 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003569  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  26.77 
 
 
259 aa  85.9  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0222  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.07 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0229  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  24.07 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0210  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  23.7 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0226  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  23.6 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0211  iron-hydroxamate transporter substrate-binding subunit  23.6 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.911967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3767  periplasmic binding protein  24.91 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0570173 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  26.01 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  29.14 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06298  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component  24.73 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.8 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  25.8 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.96 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  25.39 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.27 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1009  periplasmic binding protein  27.73 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  26.23 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  27.95 
 
 
309 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0754  FecB protein  26.01 
 
 
274 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.036257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  26.09 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  25.16 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125239  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4041  periplasmic binding protein  24.85 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0088  periplasmic binding protein  26.36 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3580  ABC transporter substrate binding protein (ferrichrome)  24.37 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  23.84 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  26.47 
 
 
322 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  26.03 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25.57 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  25.57 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2865  periplasmic binding protein  22.76 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00082186  normal  0.0250097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1439  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, periplasmic siderophore binding protein  25.78 
 
 
299 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0617961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  24.82 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0200  periplasmic binding protein  31.28 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  25.25 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1864  iron(III) dicitrate transport permease  27.06 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0163858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1969  periplasmic binding protein  26.07 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000150895  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  20.55 
 
 
662 aa  70.5  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001282  ferrichrome-binding periplasmic protein precursor  18.97 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1535  periplasmic binding protein  23.15 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1305  periplasmic binding protein  24.01 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  30.11 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4802  periplasmic binding protein  21.29 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  24.83 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2777  periplasmic binding protein  27.04 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  23.08 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1158  periplasmic binding protein  22.86 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1638  periplasmic binding protein  22.86 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  30.43 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  26.76 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  29.73 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000565066  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  29.73 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000153945  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1556  periplasmic binding protein  21.59 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243327  normal  0.668658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>