58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3816 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  248  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  60.75 
 
 
122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  55.08 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  62.5 
 
 
116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  59.81 
 
 
122 aa  124  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  59.14 
 
 
109 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  58.33 
 
 
110 aa  120  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  54.29 
 
 
116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  52.38 
 
 
114 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  53.33 
 
 
138 aa  117  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  51.38 
 
 
115 aa  116  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  50.88 
 
 
114 aa  116  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  53.4 
 
 
105 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  57.61 
 
 
119 aa  111  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  46.02 
 
 
110 aa  111  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  52.63 
 
 
105 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  52.63 
 
 
105 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  51.96 
 
 
115 aa  108  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  56.98 
 
 
120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  52.69 
 
 
122 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  50.93 
 
 
126 aa  105  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  48.21 
 
 
126 aa  104  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  43.36 
 
 
124 aa  103  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  52.13 
 
 
111 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  48.54 
 
 
112 aa  101  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  53.68 
 
 
136 aa  101  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  48.94 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  46.67 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  59.57 
 
 
118 aa  98.2  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  39.42 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  45.1 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  29.67 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  30.1 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  30.77 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  30.77 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  30.77 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  30.77 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1607  hypothetical protein  30.93 
 
 
103 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66445  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3757  hypothetical protein  30.93 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100372  normal  0.0931684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5597  hypothetical protein  26.13 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514691  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1623  hypothetical protein  30.93 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  29.79 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  29.9 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  29.9 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  29.9 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3759  protein of unknown function DUF485  29.2 
 
 
113 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  29.9 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3842  protein of unknown function DUF485  29.2 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  30.86 
 
 
102 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  32.1 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2381  hypothetical protein  32.22 
 
 
124 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5209  protein of unknown function DUF485  26.09 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4784  protein of unknown function DUF485  26.09 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  29.63 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  30.86 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5151  protein of unknown function DUF485  28.87 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  29.29 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  25.53 
 
 
104 aa  40  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>