More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3812 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  100 
 
 		 402 aa  781    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  54.96 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  42.86 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4148  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.75 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3381  histidine kinase  40.75 
 
 		 433 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  38.03 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0643  histidine kinase  34.87 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18540  signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 458 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2483  histidine kinase  42.52 
 
 		 401 aa  169  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.75 
 
 		 508 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 411 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  35.99 
 
 		 413 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  40.99 
 
 		 430 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  33.62 
 
 		 397 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  35.53 
 
 		 422 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  39.27 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  34.25 
 
 		 432 aa  133  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  37.75 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04040  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.631107  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  36.99 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 		 352 aa  129  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  34.98 
 
 		 362 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  36.03 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 451 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7345  histidine kinase  38.52 
 
 		 448 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0358279 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  37.94 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 414 aa  123  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 		 742 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  32.24 
 
 		 379 aa  120  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  31.48 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  31.82 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  34.03 
 
 		 1031 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 594 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  36.64 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 598 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  34.38 
 
 		 2361 aa  116  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 748 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 421 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 596 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  35.91 
 
 		 598 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 370 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 401 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 401 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 595 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  26.86 
 
 		 351 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0073  Histidine kinase  29.38 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  31.67 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 370 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  26.14 
 
 		 597 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 391 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 401 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  26.45 
 
 		 351 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  26.45 
 
 		 351 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  26.45 
 
 		 351 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  26.45 
 
 		 351 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  26.45 
 
 		 351 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  26.03 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  34.03 
 
 		 1048 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  30.8 
 
 		 325 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  26.03 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  39.51 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1122  histidine kinase  34.84 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  0.812788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 1168 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  31.96 
 
 		 459 aa  106  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 517 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  33.48 
 
 		 1033 aa  106  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1913  histidine kinase  30.09 
 
 		 353 aa  106  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000343654  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 546 aa  106  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 401 aa  106  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1573  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  29.18 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 461 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 725 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 581 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 490 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  32.42 
 
 		 640 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1928  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 652 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 775 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  35.32 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  31.22 
 
 		 482 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 402 aa  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  28.84 
 
 		 223 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 662 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  29.25 
 
 		 1226 aa  102  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  32.57 
 
 		 662 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  32.27 
 
 		 387 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>