More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3804 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  100 
 
 
476 aa  962    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  75.21 
 
 
482 aa  719    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  76.28 
 
 
482 aa  724    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  66.74 
 
 
474 aa  630  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5687  pyruvate kinase  66.53 
 
 
474 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0177756  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  64.19 
 
 
472 aa  611  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  64.97 
 
 
472 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2490  pyruvate kinase  64.42 
 
 
476 aa  610  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  64.19 
 
 
472 aa  608  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  64.76 
 
 
472 aa  609  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  64.76 
 
 
472 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  64.76 
 
 
472 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  64.76 
 
 
472 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2940  pyruvate kinase  64.29 
 
 
477 aa  604  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  63.25 
 
 
471 aa  595  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11633  pyruvate kinase  62.63 
 
 
472 aa  594  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.104788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  62.77 
 
 
476 aa  587  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  62.34 
 
 
477 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  62.05 
 
 
474 aa  578  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  61.83 
 
 
476 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  61.06 
 
 
476 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  60.08 
 
 
481 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  60.21 
 
 
505 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  57.81 
 
 
487 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  57.29 
 
 
493 aa  538  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  57.66 
 
 
478 aa  535  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  60.9 
 
 
474 aa  537  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1678  pyruvate kinase  60.39 
 
 
471 aa  532  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0855403  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  57.82 
 
 
471 aa  531  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14930  pyruvate kinase  59.15 
 
 
489 aa  527  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  58.55 
 
 
496 aa  522  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  57.69 
 
 
496 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1505  pyruvate kinase  54.87 
 
 
478 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.33251  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  55.44 
 
 
472 aa  504  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20690  pyruvate kinase  57.78 
 
 
472 aa  502  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0604306  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  57.26 
 
 
495 aa  501  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12930  pyruvate kinase  54.27 
 
 
470 aa  457  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.18078  normal  0.227064 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0607  pyruvate kinase  48.64 
 
 
479 aa  417  9.999999999999999e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  46.6 
 
 
480 aa  411  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  45.86 
 
 
582 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0741  pyruvate kinase  47.18 
 
 
480 aa  409  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.580936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  43.88 
 
 
584 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  45.68 
 
 
480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  45.57 
 
 
585 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  47.53 
 
 
594 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  45.51 
 
 
590 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  46.61 
 
 
478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  45.59 
 
 
596 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  46.82 
 
 
479 aa  402  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  43.01 
 
 
580 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  45.11 
 
 
480 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  46.61 
 
 
482 aa  402  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  49.04 
 
 
474 aa  403  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  44.37 
 
 
583 aa  402  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  45.16 
 
 
596 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  44.68 
 
 
583 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  45.55 
 
 
480 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  45.34 
 
 
589 aa  399  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  45.38 
 
 
597 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  45.38 
 
 
596 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  46.9 
 
 
600 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  46.14 
 
 
479 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  46.7 
 
 
471 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  46.28 
 
 
587 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  45.88 
 
 
483 aa  395  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  44.54 
 
 
481 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  41.4 
 
 
583 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  44.3 
 
 
485 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  46.91 
 
 
474 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  44.33 
 
 
481 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  45.32 
 
 
478 aa  391  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  45.55 
 
 
601 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  46.37 
 
 
592 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  46.37 
 
 
592 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  45.24 
 
 
483 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  44.68 
 
 
494 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  42.83 
 
 
585 aa  385  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  46.38 
 
 
471 aa  385  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2404  pyruvate kinase  41.26 
 
 
474 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.824082  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  44.09 
 
 
485 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  43.58 
 
 
478 aa  385  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  46.72 
 
 
474 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  44.21 
 
 
578 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  42.83 
 
 
585 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  42.83 
 
 
585 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  43.04 
 
 
585 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  43.04 
 
 
585 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  43.04 
 
 
585 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  43.04 
 
 
585 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  43.04 
 
 
585 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  42.83 
 
 
585 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2116  pyruvate kinase  40.84 
 
 
474 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  41.75 
 
 
476 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  42.04 
 
 
581 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  43.31 
 
 
476 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  47.37 
 
 
489 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  44.4 
 
 
580 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  42.83 
 
 
585 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  46.84 
 
 
477 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  42.62 
 
 
585 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>