196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3778 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3778  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
319 aa  658    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1920  beta-lactamase domain protein  68.14 
 
 
320 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1866  beta-lactamase domain protein  69.4 
 
 
320 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.914687  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0775  beta-lactamase domain-containing protein  64.78 
 
 
319 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.366597  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18970  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  63.52 
 
 
319 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0850103  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0813  beta-lactamase domain protein  60.25 
 
 
322 aa  375  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0565  putative metallo-beta-lactamase family protein  48.11 
 
 
318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.612107  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  47.17 
 
 
316 aa  318  6e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0906  Beta-lactamase-like  48.43 
 
 
316 aa  315  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.681093  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  47.48 
 
 
316 aa  315  9e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  47.8 
 
 
316 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5154  beta-lactamase domain protein  47.17 
 
 
317 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692962  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0890  beta-lactamase-like  46.23 
 
 
317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434485  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  46.23 
 
 
316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0922  beta-lactamase-like  45.43 
 
 
318 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  47.35 
 
 
319 aa  298  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  47.04 
 
 
319 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  47.35 
 
 
321 aa  296  4e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  46.27 
 
 
319 aa  295  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  47.15 
 
 
318 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  47.15 
 
 
318 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  47.15 
 
 
318 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  47.04 
 
 
332 aa  294  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  47.15 
 
 
318 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  47.15 
 
 
318 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  47.15 
 
 
318 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  47.15 
 
 
318 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  46.11 
 
 
319 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  46.71 
 
 
317 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4299  beta-lactamase domain-containing protein  47.17 
 
 
321 aa  292  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4534  beta-lactamase-like  47.35 
 
 
319 aa  292  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000147099  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1394  metallo-beta-lactamase family protein  46.2 
 
 
318 aa  291  8e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  45.96 
 
 
319 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  45.96 
 
 
336 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  45.96 
 
 
319 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0849  beta-lactamase domain protein  46.42 
 
 
321 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0185105  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  44.72 
 
 
319 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  45.34 
 
 
339 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  45.34 
 
 
339 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  45.96 
 
 
319 aa  289  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  44.72 
 
 
319 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  44.86 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0292  beta-lactamase domain protein  44.97 
 
 
319 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5107  beta-lactamase domain protein  46.35 
 
 
321 aa  278  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.065858  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  45.79 
 
 
335 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  45.79 
 
 
335 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  44.86 
 
 
319 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  44.86 
 
 
319 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  43.5 
 
 
329 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  50.62 
 
 
264 aa  235  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  25.32 
 
 
308 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  27.56 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 
299 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  28.35 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  27 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  27.31 
 
 
438 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  24.91 
 
 
300 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  23.1 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  24.82 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  30.04 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3400  beta-lactamase domain-containing protein  24.82 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  25.5 
 
 
591 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  27.35 
 
 
323 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  27.31 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  26.94 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  25.32 
 
 
362 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  28.5 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  26.71 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  22.96 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  31.87 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  24.54 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  31.85 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1299  beta-lactamase-like protein  54.17 
 
 
49 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.714571  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2433  metallo-beta-lactamase family protein  22.55 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000453521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2969  metallo-beta-lactamase family protein  22.98 
 
 
288 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  normal  0.106723 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2362  metallo-beta-lactamase family protein  22.98 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1709  beta-lactamase-like  27.11 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.587452  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  23.95 
 
 
367 aa  67  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2499  metallo-beta-lactamase family protein  22.55 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2207  beta-lactamase domain-containing protein  23.14 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.888574  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  31.52 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.91 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  30.6 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  33.12 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  25.08 
 
 
425 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2155  Zn-dependent hydrolase  22.13 
 
 
288 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1827  beta-lactamase domain-containing protein  31.15 
 
 
291 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.021079  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  23.75 
 
 
342 aa  63.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1646  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2714  metallo-beta-lactamase family protein  25.35 
 
 
325 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2235  metallo-beta-lactamase family protein  22.13 
 
 
288 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2399  metallo-beta-lactamase family protein  22.13 
 
 
288 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.295399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2169  Zn-dependent hydrolase  22.55 
 
 
288 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0145337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>