More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3699 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  100 
 
 
510 aa  1004    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  65.11 
 
 
499 aa  612  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  62.17 
 
 
505 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  61.07 
 
 
508 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  58.79 
 
 
500 aa  544  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  57.72 
 
 
516 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  56.36 
 
 
509 aa  522  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  56.12 
 
 
511 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  56.57 
 
 
516 aa  519  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  55.71 
 
 
498 aa  512  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  51.1 
 
 
505 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  44.94 
 
 
503 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  49.39 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  50.51 
 
 
501 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  47.86 
 
 
518 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  47.47 
 
 
524 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  46.87 
 
 
524 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  46.23 
 
 
524 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  42.36 
 
 
496 aa  449  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  49.8 
 
 
519 aa  450  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  46.64 
 
 
524 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  46.23 
 
 
524 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  46.46 
 
 
516 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  46.17 
 
 
523 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.12 
 
 
525 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.23 
 
 
527 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  46.03 
 
 
524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  46.73 
 
 
513 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  47.25 
 
 
522 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  44.31 
 
 
497 aa  443  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 
506 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  45.53 
 
 
524 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  46.33 
 
 
513 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 
507 aa  445  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  49.69 
 
 
508 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  45.1 
 
 
512 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  46.96 
 
 
507 aa  443  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  46.37 
 
 
521 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  45.03 
 
 
499 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  45.42 
 
 
511 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  46.96 
 
 
507 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  44.22 
 
 
494 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  45.03 
 
 
499 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  50.71 
 
 
499 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  44.38 
 
 
492 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  45.33 
 
 
525 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  45.55 
 
 
506 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  45.92 
 
 
520 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  42.54 
 
 
493 aa  433  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  46.22 
 
 
517 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  45.44 
 
 
513 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
497 aa  431  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.35 
 
 
512 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  43.5 
 
 
494 aa  430  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  41.9 
 
 
501 aa  431  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  45.38 
 
 
515 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  46.03 
 
 
506 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  45.9 
 
 
861 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  44.74 
 
 
511 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  45.1 
 
 
513 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  43.97 
 
 
492 aa  426  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  45.14 
 
 
499 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  44.65 
 
 
537 aa  427  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  44.94 
 
 
511 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  44.24 
 
 
515 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
499 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  45.21 
 
 
503 aa  426  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.14 
 
 
499 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  47.5 
 
 
514 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  43.28 
 
 
510 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  46.86 
 
 
512 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  46.86 
 
 
512 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  42.34 
 
 
508 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  44.02 
 
 
501 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  44.51 
 
 
496 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.82 
 
 
494 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 
494 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  47.73 
 
 
519 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  43.14 
 
 
517 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  43 
 
 
494 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.09 
 
 
501 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 
494 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  44.51 
 
 
496 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.51 
 
 
496 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 
496 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  45.67 
 
 
504 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  46.34 
 
 
495 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 
494 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  40.89 
 
 
501 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  44.44 
 
 
506 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.62 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  42.24 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  42.94 
 
 
506 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  46.98 
 
 
513 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  40.77 
 
 
504 aa  413  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  46.26 
 
 
512 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  43.55 
 
 
505 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2999  ABC transporter related protein  43.8 
 
 
515 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.776135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>